Permafrost soil bacteria in Barrow Peninsula, Arctic (2015)
文件分为2类,第一为测序下机数据,文件后缀为.fq;第二类为处理后的OTU表,文件后缀为.txt。
文件命名:下机数据文件的名称为permafrost age+thaw status+replicationID.read.fq, age 为冻土年龄,包括:young (<50 years old), medium (<300 years old), old (<3000 years old)和ancient (3000–5000 years old); thaw status为冻土状态,包括permanently frozen, transition和active;replication ID为实验重复,包括1-4;read为测序方向,包括R1(正向)和R2(反向)
数据读取方式:下机数据可用文本程序(如记事本)打开,主体内容为测序碱基质量;处理后的OTU表可用MS excel打开,主题内容为基于97%序列identity的OTU表及物种分类信息。
孔维栋. (2021). 北极Barrow地区冻土土壤细菌数据集(2015). 时空三极环境大数据平台,
DOI:
10.11888/Soil.tpdc.271248.
CSTR:
18406.11.Soil.tpdc.271248.
[Kong, W. (2021). Permafrost soil bacteria in Barrow Peninsula, Arctic (2015). A Big Earth Data Platform for Three Poles,
DOI:
10.11888/Soil.tpdc.271248.
CSTR:
18406.11.Soil.tpdc.271248.
]
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1. Ji, M., Kong, W., Liang, C., Zhou, T., Jia, H., and Dong, X. (2020). Permafrost thawing exhibits a greater influence on bacterial richness and community structure than permafrost age in Arctic permafrost soils. The Cryosphere, 14, 3907–3916, https://doi.org/10.5194/tc-14-3907-2020.( 查看 | Bibtex格式)
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