Post-processing products for typical year ice bacteria distribution in the Tripolar regions (2010-2018)
典型年三极冰雪微生物后处理产品收集了2010-2018年期间南北极以及青藏高原地区冰川、冰川雪和冰里采样细菌分析结果。通过整理归纳汇总得到三极区域土壤微生物后处理数据产品，数据格式为excel，方便用户查看。其中南北极和青藏高原地区冰川雪和冰里原核为刘勇勤老师实验组在2010-2018年间从NCBI数据库收集的细菌16S核糖体RNA基因序列。收集的序列通过使用DOTOUR软件计算序列之间相似度，相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU，并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过“Classifier”软件与RDP数据库进行比对，在可靠性大于80%的情况下鉴定到属一级水平；青藏高原冰川采集时间为2010-2018年间，包含刘勇勤老师实验组分离的青藏高原7条冰川（珠峰东绒布冰川，天山一号冰川，古里雅冰川，老虎沟冰川，木孜塔格冰川，七一冰川和玉珠峰冰川），向述荣老师分离的马兰冰川和张新芳老师分离的若岗日冰川的细菌16S核糖体RNA基因序列。冰川样品采集后带回北京青藏高原院研究所生态实验室和兰州冰冻圈国家实验室，涂布平板后于不同温度下（4-25摄氏度）培养20天-90天并挑取单菌落纯化。分离的细菌提取DNA后以27F/1492R引物扩增16S核糖体RNA基因片段，并使用Sanger法测序。16S核糖体RNA基因序列通过“Classifier”软件与RDP数据库进行比对，在可靠性大于80%的情况下鉴定到属一级水平。
1. 投影：WGS84
2. 数据大小：82 KB
3. 数据格式：Excel数据库
叶爱中. (2022). 典型年三极冰雪微生物后处理产品（2010-2018）. 时空三极环境大数据平台,
DOI:
10.11888/Cryos.tpdc.272752.
CSTR:
18406.11.Cryos.tpdc.272752.
[Ye, A. (2022). Post-processing products for typical year ice bacteria distribution in the Tripolar regions (2010-2018). A Big Earth Data Platform for Three Poles,
DOI:
10.11888/Cryos.tpdc.272752.
CSTR:
18406.11.Cryos.tpdc.272752.
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