高原鼠兔（Ochotona curzoniae）是青藏高原特有的草食性小型兽类，主要栖居于开阔的海拔2800-5000米的高寒草甸、草原及荒漠草原地带。子课题（2019QZKK05010212）拟选择对环境变化极为敏感的恒温小型兽类——高原鼠兔为代表，通过野外调查比较青藏高原及邻近地区不同海拔鼠兔种群的形态、生理和生活史的差异。本数据集包含2020年在青海，2021年在西藏自治区玛多县调查高原鼠兔并拍摄的个体照、生境照、工作照，包括高原鼠兔洞穴照片10余张、鼠兔活动视频1个。
张学英
高原鼠兔是青藏高原的关键物种，是伴随青藏高原隆升而形成的土著物种，在长期的进化过程中，演化出了独特的生活史策略适应高原极端环境。子课题（2019QZKK05010410）调查高原鼠兔的分布区域，分析其在全球气候变化的大背景下种群波动规律及其影响因素，探讨高原鼠兔在高寒草甸生态系统中的生态学意义。本数据集包含2020年在青海省海南州共和县、贵南县，果洛州玛沁县采集的213份高原鼢鼠组织样品信息表，记录包括物种、采集地、采集时间、采集人、样品类型等信息。信息表以子课题编号-年度-类群命名，用excel打开
曲家鹏
为摸清西藏牦牛现阶段资源数量、分布以及利用现状，为西藏牦牛多样性保护及利用奠定基础，子课题（2019QZKK05010705）2021-2022年期间在西藏自治区调查牦牛遗传资源并采集组织样品，包括查吾拉牦牛（20头）、江达牦牛（21头）、类乌齐牦牛（65头）、帕里牦牛（20头）、斯布牦牛（20头）、西藏高山牦牛（20头）。本数据集包含6个组织样品信息表和照片视频。信息表记录包含性别、年龄、体重、体高、采样地等信息，照片包含个体外观照，生境照，工作视频。
信金伟
为完成青藏高原及周边地区藏系绵羊资源调查，掌握藏系绵羊资源现状，2020年度对甘肃甘南藏族自治州玛曲县、夏河县开展藏系绵羊种质资源调查，采集500份血液及组织样品。本数据集包含1个组织样品信息表，包含物种、品种、采集地、采集时间、样品类型等信息，以excel格式存储。拍摄个体照片100张，生境照10张，工作照9张，视频2个。照片以jpg格式存储，视频以mp4格式存储。对每个个体产生50000个基因型数据，共计500个个体的SNP基因组分型数据，数据以“ped”和“map”格式存储。
李孟华
为描述青藏高原重要畜禽种质资源遗传多样性分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2022年集中在四川省九龙县、红原县、乡城县开展家养动物遗传资源调查，采集484份绵羊、牦牛、山羊、家犬、家猪、黄牛血液及组织样品，绵羊粪便样品40份，2只藏鸡各组织RNA样品，3只藏猪各组织RNA样品。本数据集包含1个样品信息表和个体照片685张，工作照片12张，生境照5张，工作视频12个。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。照片以jpg格式存储，视频以MP4格式存储。
彭旻晟
本数据集为2022年出版的西藏毛唇蚁甲亚族分类学专著《The Batrisini of Tibet: unveiling an enigmatic ant-loving beetle diversity at Earth’s “Third Pole” (Coleoptera, Staphylinidae, Pselaphinae)》中100个图版的原始TIFF文件，包含各个物种的整体图、鉴定特征图、分布地图和采集环境图等。
殷子为
本数据包括青藏高原中部的25个湖泊的细菌16S核糖体RNA基因序列数据，样品采集时间为2015年7月-8月，使用2.5升采样器对地表水进行了三次重复采样。样品采集后立即带回北京青藏高原研究所生态实验室，所取盐湖的盐度梯度为0.14 ~ 118.07 g/L。本数据为扩增子测序结果。将湖水在0.6 atm过滤压力下浓缩到至0.22μm膜上，然后通过FastDNA SPIN Kit 提试剂盒提取DNA，16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')。使用Illumina MiSeq PE250测序仪进行对端测序，原始数据通过Mothur软件进行分析，序列与Silva128数据库进行比对并以97%的同源性将序列划分为操作分类单元（OTU）。本数据可用于分析青藏高原湖泊微生物多样性研究。
孔维栋
本数据包括青藏高原纳木错地区土壤细菌分布数据，可用来探索围栏和放牧对纳木错地区土壤微生物的季节性影响，样品采集时间为2015年5月至9月，土壤样品用冰袋保存，运回北京青藏高原研究所生态实验室；本数据为扩增子测序结果，使用MoBio Powersoil™DNA分离试剂盒提取土壤DNA，引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3')和806R (5'GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3')，扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序。原始数据通过Qiime软件进行分析，之后计算序列之间相似度，并在相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU。采用Greengenes参考文库进行序列比对，去除了只在数据库中出现一次的序列。土壤含水率和土壤温度由土壤温湿度计测得，土壤pH值用pH计测定(Sartorius PB-10, Germany)，用2 M KCl(土壤/溶液，1:5)提取土壤硝态氮(NO3−)和铵态氮(NH4+)浓度，并用Smartchem200离散自动分析仪进行分析。本数据集对研究干旱半干旱草原土壤微生物多样性具有重大意义。
孔维栋
青藏高原草地土壤细菌多样性数据。样品采集时间为2017年7月至8月，包含高寒草甸，典型草原，荒漠草原3种生态系统共计120个样品。土壤表层样品采集后用冰袋保存，运回北京青藏高原研究所生态实验室，通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取土壤DNA，16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 806R (5´GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3´)，扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序。原始数据通过Qiime软件分析，序列分类依据Silva128数据库，将相似度在97%以上的序列聚类为一个操作分类单元（OTU）。本数据系统地比较了青藏高原样带草地土壤微生物的细菌多样性，对研究微生物在青藏高原的分布具有重大意义。
孔维栋
《2015年第三极部分湖泊水体细菌后处理产品和常规水质参数》数据集收集了2015年期间青藏高原地区部分湖泊水体采样细菌分析结果和常规水质参数。通过整理归纳汇总得到2015年第三极部分湖泊水体细菌后处理产品，数据格式为excel，方便用户查看。样品由计慕侃老师采集于2015年7月1日至7月15日，包含28个湖泊（巴木错，白马纳木错，班戈错（盐湖）， 班公错，崩错，别若则错，错鄂（申扎），错鄂（那曲），达瓦错，当穹错，当惹雍错，洞错，鄂雅错，公珠错，果根错，甲热布错，玛旁雍错，纳木错，聂尔错（盐湖），诺尔玛错，朋彦错（盐湖），蓬错，枪勇错，色林错，吴如错，物玛错，扎日南木错，扎西错），共计138个样品。其中湖泊水体细菌DNA提取方法如下：湖水过滤到0.45膜上，然后通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取DNA。16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')。测序方式为Illumina MiSeq PE250，原始数据通过Mothur软件分析，包括quality filtering, chimera removal,序列分类依据Silva109数据库，古菌、真核和未知来源序列已被移除。OTU以97%相似度分类，然后移除仅在数据库中出现一次的序列。常规水质检测参数包括：溶解氧、电导率、溶解性总固体、盐度、氧化还原电位、不挥发有机碳、总氮等。其中，溶解氧采用电极极谱法；电导率采用电导率仪；盐度采用盐度计；溶解性总固体采用TDS测试仪；氧化还原电位采用ORP在线分析仪；不挥发有机碳采用TOC分析仪；总氮采用分光光度法分别得到水质参数结果供参考。
叶爱中
采用红外相机调查法获取地栖大中型野生动物的出现数据。2021年布设红外相机262台，获得野生动物照片12391张，记录到大中型哺乳动物41种。小型兽类数据包含物种、多度、体重等性状数据、环境梯度数据等，可为理解环境梯度-物种多度-物种性状间的关联及垂直梯度哺乳动物群落构建的生态过程提供数据支撑。红外相机数据主要收集珍稀濒危野生动物的出现数据，可补充区域生物多样性本底，同时为生物多样性热点区及保护关键区识别提供科学依据。
李学友
为描述青藏高原重要畜禽种质资源遗传多样性分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2019-2022年期间在青海省海北藏族自治州刚察县采集2167份、1056份、516份当地藏羊和细毛羊组织样品，记录2074份、1548份产羔记录。本数据集包含3个组织样品信息表，2个产羔记录信息表。组织样品信息表记录品种、采集地、采集时间、样品类型等信息。产羔记录信息表记录品种、详细采样地、性别、出生日期、初生重等信息。信息表以excel表形式存储。
赵凯
为完成青藏高原及周边地区藏系绵羊资源调查，掌握藏系绵羊资源现状，2021-2022年度对青海、甘肃、青海、贵州、陕西、云南、新疆、四川开展藏系绵羊种质资源调查，采集1021份血液及组织样品。本数据集包含1个组织样品信息表，包含物种、品种、采集地、采集时间、样品类型等信息，以excel格式存储。拍摄个体照片230张，生境照61张，工作照22张，视频6个。照片以jpg格式存储，视频以mp4格式存储。对每个个体产生50000个基因型数据，共计1000个个体的SNP基因组分型数据，数据以“ped”和“map”格式存储。
李孟华
第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题三“高原微生物多样性保护和可持续利用”（2019QZKK0503）第一、二年度共计开展30余次野外科学考察，足迹覆盖了青藏高原大部分地区，包括对藏东南、羌塘高原、可可西里、喜马拉雅区等区域冰川（如枪勇冰川、唐古拉冰川、珠峰东绒布冰川、杰马央宗冰川、帕隆4号冰川等）、湖泊（昂仁金错、错果、托素湖等）、河流（雅鲁藏布江等）、溪流、土壤、真菌地衣、动物多圈层微生物的考察。该数据集包含本专题第一、二年度野外考察收集的生境照、工作照、科考影像等电子数据，共计6,471个照片视频（其中照片6,124张）。
刘勇勤
2021年仍采用样点法对岗日嘎布山沿海拔梯度的鸟类进行调查，按400米海拔跨度对考察区域分别设置海拔带，北坡从波密县通麦镇至嘎隆寺，由低到高设置了5个海拔带，南坡从墨脱县背崩乡解放大桥至嘎隆拉，由低到高设置了8个海拔带，获取岗日嘎布西北段南北坡鸟类多样性和分布数据，以期对理解这一区域鸟类多样性的形成和维持机制方面取得重大突破，进一步探讨气候变化对鸟类多样性的影响与适应策略、物种多样性对全球变化的响应与保护策略等关键科学问题。
王洁
该数据集包含2016年11月至2020年8月在青藏高原采集的15条冰川共269个冰雪样品微生物扩增子测序数据，包括24K冰川（24K）、冬克玛底冰川（DKMD）、敦德冰川（DD）、杰玛央宗冰川（JMYZ）、廓琼岗日冰川（KQGR）、来古冰川（LG）、帕隆4号冰川（PL4）、羌塘1号冰川（QT）、枪勇冰川（QY）、曲玛冰川（QM）、唐古拉龙匣宰陇巴冰川（TGL）、夏岗江冰川（XGJ）、雅拉冰川（YA）、泽普沟冰川（ZPG）、珠峰东绒布冰川（ZF）。采样区域经纬度范围为28.020°N到38.100°N和86.28°E到95.651°E。 通过聚合酶链式反应（PCR），采用515F/907R（或515F/806R）引物对16s rRNA基因的V4-V5区（或V4区）片段进行扩增，并用Illumina Hiseq2500测序平台测序获得原始数据。所选引物序列分别为：“515F_GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; 907R_CCGTCAATTCMTTTRAGTTT”“515F_GTGCCAGCMGCCGCGG, 806R_GGACTACHVGGGTWTCTAAT”。上传的数据包括：样品编号，样品描述，采样时间，经纬度坐标，样品类型，测序目标，测序片段，测序引物，测序平台，数据格式等基础信息，测序数据以序列文件数据格式正向 *.1.fq.gz和反向 *.2.fq.gz压缩文件储存。
刘勇勤
通过2019和2020年度的科考工作，第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题3课题4地衣科考分队（2019QZKK05030400）对青藏高原地区大量的地衣采集空白区域进行了补充采集。2019年度科考首次深入对藏北阿里地区进行地衣生物多样性深度考察，2020年度对可可西里，三江源等地衣考察空白地区进行野外考察和标本采集。这些考察工作揭开了青藏高原地区地衣组成的神秘面纱，填补了国内对该地区馆藏的空白。 本数据集包含自2019年7月至2020年9月在西藏自治区、青海省、四川省、云南省采集的10,283号地衣标本信息，其中包括采集生境、采集时间、采集人、经纬度、海拔、拉丁学名等信息。包含标本照片4,328张，其中2019年815号地衣标本的2,425张照片，2020年543号标本的1,903张照片。实体标本储存于中国科学院昆明植物研究所标本馆（KUN）。标本采集信息和野外生态照片等均在Biotracks数据库和KUN标本数据库等各个数据库之间实现了同步，便于相关人员后期研究、整理和查询。标本目前在KUN标本馆内按时间、地区、属名排序并单独存放，便于后续研究，并且都保存了相应的分子材料或获得了分子序列，为后续标本的分类和系统学研究奠定了良好的材料基础。目前也正在开展各类群的DNA提取和系统分类学研究工作。
王欣宇
为研究青藏高原及周边地区主要马属驯化动物的群体演化历史和局部适应遗传机制，并建立相应的种质遗传资源库。我们对在青海省、西藏自治区、新疆自治区采集的青藏高原及周边地区的马属样本进行测序：包括藏家驴、平原家驴等品种。测序包括denove和重测序数据，为追溯该地区主要马属驯化动物的驯化、迁徙、扩张等群体历史事件，并进一步探讨马属动物对缺氧、高寒、干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。同时，对家驴各组织进行测序，测序包括HIFI基因组数据、HiC基因组数据，为组装完整的驴的基因组做准备，便于后续分析。
李艳
为描述青藏高原重要啮齿动物遗传多样性分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2021年本子课题（2019QZKK05010410）集中在青海海西蒙古藏族自治州、果洛州、海南州开展高原鼠兔调查，共采集200份高原鼠兔样品，实体样品为脾、肺组织。本数据集包含1个样品信息表和生境照、工作照、工作视频。样品信息表包含物种、性别、详细采样地、海拔、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。
曲家鹏
为描述青藏高原高原鼠兔种质资源遗传多样性分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2021年子课题（2019QZKK05010209）集中在青海省（海西蒙古族藏族自治州，格尔木市，昆仑山口；海西蒙古族藏族自治州，都兰县，香日德镇，沟里乡；果洛藏族自治州，玛多县；果洛藏族自治州，玛沁县，大武镇；黄南藏族自治州，泽库县；海南藏族自治州，贵南县，塔秀乡）不同海拔区域采集93份高原鼠兔种质资源，实体样品包括血液或、组织、粪便等。本数据集包含1个样品信息表。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。
张良志
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