本数据是研究团队采用新方法定量重建获得的末次冰盛期以来青藏高原不同样点的植被变化数据。首先收集、整理青藏高原及其周边17个植被带1802条现代孢粉数据作为训练集,采用随机森林算法建立基于孢粉数据重建青藏高原植被的模型,该模型预测现代孢粉样点的植被时,与实际植被对比,显示出较高的一致性(>76%)。与传统的生物群区化法相比,新建立的随机森林模型基于孢粉数据预测青藏高原现代植被的准确性更高。随后,将新建立的随机森林模型用于青藏高原51条孢粉化石序列的古植被重建。用贝叶斯方法重新建立各孢粉化石序列的深度-年代模型,并用线性插值方法获取500年间隔的孢粉化石数据。最终用随机森林模型重建出青藏高原22000年以来500年间隔的植被时空格局变化。本数据可以为理解过去高寒植被的变化过程和机制提供依据,为研究过去气候变化对青藏高原植被的影响提供证据,为气候模拟提供边界条件。
秦锋, 赵艳, 曹现勇
1) 数据内容:该数据是对青藏高原林芝地区立定遗址文化层堆积剖面进行研究产生的古DNA数据,包括4个层位10个堆积物古DNA样本的HiseqX宏基因组预测序数据。可以用来初步分析林芝立定遗址堆积物古DNA记录的物种组成的历时性变化,揭示当地古代农业发展的历程。 2) 数据来源及加工方法:课题组自有数据,利用Pair-end建库测序方法和illumina HiseqX测序平台检测获取。 3) 数据质量:20.3MB数据量,Q30>85%。 4) 数据应用成果及前景:数据用于探索遗址堆积物古DNA在揭示青藏高原古代农业发展历程中的研究潜力。
杨晓燕
本数据为“Major turnover of biotas across the Oligocene/Miocene boundary on the Tibetan Plateau” (中文标题“青藏高原渐新世——中新世界线生物群的重大转换”)论文的全文相关图片数据。 数据来源为论文作者绘制或拍摄的原创图片的高清原图版本。 数据加工方式:原始图片未经二次加工。 数据可作为青藏高原隆升、环境及生物群变化等研究的参考资料。 该论文数据可在征得论文相关作者同意及注明出处的前提下引用。
邓涛
本数据集来源于论文:Tang, H. et al. (2020). Early Oligocene vegetation and climate of southwestern China inferred from palynology. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 560, 109988. doi:10.1016/j.palaeo.2020.109988 数据中包含论文中的补充数据,主要包括:(1)利用采集的孢粉样品统计计算得到的孢粉百分比;(2)重建的早渐新世文山、吕合,晚始新世剑川三处古植物群的植被功能类型。 研究人员在青藏高原东南缘,云南省吕合镇发现了一个含化石的剖面,根据火山凝灰岩的铀-铅同位素测得其年代为早渐新世(~33-32 Ma)。剖面总厚度约为18米,本研究中,研究人员在剖面上采集了55份孢粉样品,每个样品为2-2.5 g,后用 KOH (10%)、 HCl (10%)和 HF (39%)处理,然后在超声槽中用5μm 尼龙网过滤样品,保留残余物。利用光学显微镜和扫描电子显微镜对孢子和花粉进行了鉴定。用毛细管采集单个孢粉粒,转移到铜质扫描电镜样品台上,后镀金,用 Zeiss EVO LS10扫描电镜对单个孢粉粒进行观察。在400倍的光学显微镜下进行孢粉统计,每个样品至少计300粒,之后计算不同类群孢粉的百分比。 随后,研究人员按照Prentice et al. (1996),Prentice and Jolly (2000) 和Ni et al. (2010)的方法重建了古植被。根据已发表的数据(Ni et al. 2010),通过古植物群与现代植物功能类型的相似性比较,重建了古生物群面貌。利用欧几里德距离(Prentice et al., 1996)和Jaccard指数系数(Pound and Salzmann, 2017)研究了古植物群与现代植物群的相似性,采用 R 包“ clusteval”中的“ Jaccard 指数系数”计算了相似度。古植物群落被划分为相似性得分最高的生物群落,同时考虑到了优势类群或关键类群。
唐赫
数据包含兰州大学地质科学与矿产资源学院古生物教研室2019年至2020年期间采自于甘肃、青海、云南的新生代植物大化石;化石均由团队成员赴野外采集而来,并在实验室中通过常规化石修复方法与角质层实验方法进行加工;化石保存基本完好,其中部分保存有角质层,可以进行实验并一步观察到气孔等微细结构,有助于分类鉴定及恢复古气候条件;对这些植物大化石的研究有助于深入了解青藏高原东部新生代古环境、古气候、古地理变化以及认识当时的植被面貌。
杨涛
本数据集来源于论文:Deng, W. et al. (2020). Sharp changes in plant diversity and plant-herbivore interactions during the Eocene–Oligocene transition on the southeastern Qinghai-Tibetan Plateau. Global and Planetary Change, 194, 103293. doi:10.1016/j.gloplacha.2020.103293 数据主要包含青藏高原东南部芒康县卡均植物群在始新世晚期与早渐新世早期由草食动物损坏后的植物叶片化石记录数据。 叶片化石上食草动物的损害类型对探索古环境变化下的动植物相互作用发展和更好的理解土壤生态系统进化历史十分重要。始新世-渐新世过渡期(EOT)是一个古气候剧烈变化的时期,对全球生态系统产生了重大影响,研究人员对青藏高原东南部芒康县卡均植物群的分类组成进行了鉴定,对始新世晚期(MK-3,~ 34.6 Ma)与早渐新世早期(MK-1,~ 33.4 Ma)两个时期植物化石叶片上保存完好的草食动物造成的破坏进行了研究。 本数据中包含了研究中的植物化石叶片记录数据,数据表中包含字段如下: Basic Code(基础编号); Database RFID(数据库编号); Family code(家族编码); Genera code(基因编码); Species code(种类编码); Marks(标记); Plant-herbivore(植食性破坏); Leaves for damage(损害叶片数量); FFGs & DTs(昆虫损害类型); Code marks(损害类型标记); Hole feeding(虫洞取食); Margin feeding(边缘取食); Skeletonization(留脉取食); Surface feeding(表面取食); Piercing & Sucking(刺吸式); Oviposition(产卵式); Mining(潜叶式); Galling(虫瘿式); Fungal(真菌式); Incertae Sedis(地位未定式); Boring(钻孔式); Undefined(未定义) 数据中也包含论文中部分图形数据。
邓炜煜东, 苏涛
大气中的花粉是植物在开花期散布在大气中产生的,受植物的开花物候和气候等因素的影响。作为一种大气生物颗粒,大气花粉能够反映植物物候、气候条件、大气环流等的变化。大气花粉由珠峰站Burkard大气花粉采样器收集,该收集器是容积式花粉收集器,每分钟气流为10L,大气花粉颗粒被吸附在聚酯薄膜上,每周更换一次,收集下来的样品用甘油胶制成玻片,放在奥林巴斯显微镜400倍下进行鉴定,统计花粉科属类型和数量。数据集的时间覆盖范围是2011-2013年,时间分辨率为逐日。所采用的大气花粉采样装备为国际通用的采样器,遵循标准的采样和实验室处理流程,并由经验丰富的孢粉鉴定人员鉴定,确保数据真实、可靠。该数据可供该区域利用花粉分析重建古环境、植物物候响应气候变化等生态学研究做参考。
吕新苗
本数据集来源于论文:Gao, S., Zhou, T., Yi, C., Shi, P., Fang, W., Liu, R., Liang, E., & Julio Camarero, J. (2020). Asymmetric impacts of dryness and wetness on tree growth and forest coverage. Agricultural and Forest Meteorology, 288-289, 107980. doi:10.1016/j.agrformet.2020.107980. 数据提取自论文内Supplementary Materials中的表格数据。 此论文以美国西南部科罗拉多高原半干旱区森林为研究对象,综合应用大量的树轮宽度数据,结合遥感森林覆盖数据,通过在区域尺度设计“自然试验”(natural experiments),探讨了年际水分亏缺叠加影响下的滞后效应,并对比了年际间水分状况变化对树轮宽度和森林盖度影响的异同。研究发现,树轮形成当年的水分状况可显著影响滞后效应的持续时间及强度;树轮宽度与森林盖度对年际间水分状况的响应存在差异。 数据中包含357个采样点,111个水文年(1902-2012年)的年轮宽度指数(RWI)和与之匹配的年度水分亏缺异常(Dya)数据。 研究中使用的年轮数据由研究区域内三个主要物种的357个标准年表组成,时间跨度为1902年至2012年,总共有29,969个站点-年。三个主要物种的357个树年轮宽度年表来自国际树轮数据银行(International Tree-Ring Data Bank,https://www.ncdc.noaa.gov/data-access/paleoclimatology-data/datasets/tree-ring)。使用ARSTAN程序通过负指数曲线消除了由老化和树干直径增加引起的长期趋势(Cook, 1985),将树木年轮宽度数据转换成了年轮宽度指数(RWI)。进行标准化后,为了减少这些树环站点之间的空间异质性,所有年表均按具有可比方差的标准均值(RWI = 1000)进行了缩放。 研究中使用了年度水分亏缺异常(Dya)来探讨水分亏缺变异性对树木径向生长和生长遗产的影响。将网格化的Dya与RWI进行了匹配,为了减少由于气候数据的粗略解析而引起的偏差,对于同一网格内的树木年轮年表,将它们进行了每年平均。 数据集包含1个Excel数据文件,Ring-width indices and annual water deficit anomaly (1902-2012) 包含三张数据表,数据表名称分别为: raw_data:原始数据 processed_data:加工后的数据 variables:变量 数据中包含以下字段: sitename:树木年轮采样点的名称 Year:年轮形成年 RWI:年轮宽度指数 latitude:树木年轮采样点的纬度 lontitude:树木年轮采样点的经度 altitude:树木年轮采样点的高程 lon Grid No .:树木年轮采样点的经度网格号 lat Grid No .:树木年轮采样点的纬度网格号 Dya_3:年轮形成年(即“年”列)前第三年的缺水异常 Dya_2:年轮形成年(即“年”列)前第二年的缺水异常 Dya_1:年轮形成年(即“年”列)前第一年的缺水异常 Dya_curr:年轮形成年(即“年”列)的缺水异常 Dya_std:111个水文年(即1902-2012年)的标准年平均网格缺水量
高姗
Data set contains tree age of trees growing at different glacier moraines in the central Himalayas. The data were obtained using tree ring samples. Cores samples were collected (almost near to the ground level to estimate the minimum age of the related moraine) using an increment borer. Samples were processed by using standard dendrochronological techniques.
Shalik Ram Sigdel, Hui Zhang, Haifeng Zhu, Sher Muhammad, Eryuan Liang
通过对青藏高原宗日遗址、河西走廊三角城、火石梁、缸缸洼、一个地窝南、砂锅梁、官地、茂林山、冬给错那、诺木洪、曲贡、立定等40余处新石器-青铜时代遗址进行考古调查和发掘,获取了各遗址经纬度、高程、文化属性、文化遗物等基本信息;同时,对遗址调查和发掘过程中的动植物遗存进行科学收集、鉴定和实验室分析,得到了一批遗址碳十四年代数据、光释光年代数据、动物遗存鉴定数据、植物遗存鉴定数据、碳氮稳定同位素数据、孢粉数据、真菌孢子数据和环境指标数据。该数据集为研究青藏高原新石器-青铜时代先民的活动历史和生业模式提供了数据支撑。
杨晓燕, 吕红亮, 刘向军, 候光良
本数据集来源于论文:Huang, R., Zhu, H.F., Liang, E.Y., Liu, B., Shi, J.F., Zhang, R.B., Yuan, Y.J., & Grießinger, J. (2019). A tree ring-based winter temperature reconstruction for the southeastern Tibetan Plateau since 1340 CE. Climate Dynamics, 53(5-6), 3221-3233. 在本文中,为了了解过去几百年冬季温度变化历史及其驱动因素,中国科学院青藏高原研究所高寒生态重点实验室、青藏高原地球科学卓越创新中心梁尔源研究员课题组,利用2007-2016年期间采集的树木年轮样本重建了青藏高原东南部地区公元1340年以来的冬季(11-2月)最低温度变化历史。 数据由论文作者提供,数据包含了1340-2007年青藏高原东南部昌都地区冬季的最低温度重建数据。 数据包含以下字段: year:年 Tmin.recon( ℃):重建的最低温度( ℃) 数据详细信息参见附件:A tree ring-based winter temperature reconstruction for the southeasternTibetan Plateau since 1340 CE.pdf
黄茹, 朱海峰, 梁尔源
通过对青藏高原梅诺、萨日果、容哇果、卡则、吉哈、牙日给、巴米、巴荣巴当、青土、拉布、麦松岩画、尕拉、耶则热地点1和耶则热地点4等14个历史时期遗址进行考古调查和试掘,获取了各遗址经纬度、高程、文化属性、文化遗物等基本信息;同时,对遗址调查和发掘过程中的动植物遗存进行科学收集、鉴定和实验室分析,得到了一批遗址的碳十四年代数据和动物遗存鉴定数据。该数据集为研究青藏高原历史时期先民的活动历史和生业模式提供了数据支撑。
董广辉, 侯光良
通过对青藏高原高苜蓿地、朵家梁、水口、棋盘山、新寨、参雄尕塑、鸟岛、邦嘎和白羊村等25个新石器-青铜时代遗址进行考古调查和发掘,获取了各遗址经纬度、高程、文化属性、文化遗物等基本信息;同时,对遗址调查和发掘过程中的动植物遗存进行科学收集、鉴定和实验室分析,得到了一批遗址碳十四年代数据、动物遗存鉴定数据、植物大遗存鉴定数据和碳氮稳定同位素数据。该数据集为研究青藏高原新石器-青铜时代先民的活动历史和生业模式提供了数据支撑。
董广辉, 杨晓燕, 吕红亮
本数据集包含沉错化石硅藻,沉错电导率重建,纳木错化石硅藻,纳木错电导率重建。可用于研究青藏高原湖泊现生硅藻种属组成特征及古环境定量重建。硅藻资料根据样品鉴定统计而得出,水环境资料由仪器测量得到;重建的电导率由硅藻-盐度转换函数计算得出。本数据集由实验室测量获取,由仪器或者实验完成后直接得到数据在各个环节严格按照相关操作规程进行样品和数据采集和分析。 本数据集共有6个子表: 子表1为湖泊环境,共有18个字段,分别为湖泊名称、编号、湖泊序号、纬度、经度、水深、海拔和各水环境指标; 子表2为表层沉积物硅藻,共有4个字段,分别为湖泊序号,硅藻缩写,硅藻名称和其含量; 子表3为沉错化石硅藻,有6个字段,分别为样品编号、分析编号和深度,硅藻缩写,硅藻名称和其含量; 子表4为沉错电导率重建,有3个字段,分别为深度、年龄、硅藻重建的电导率。 子表5为纳木错化石硅藻,有5个字段,前两个字段分别为深度和年龄,以后所有字段为不同种属硅藻的含量; 子表6为纳木错电导率重建,有3个字段,分别为深度、年龄、硅藻重建的电导率。 各子表中硅藻含量量纲为百分含量%,样品深度、水深、年龄、经度、纬度、海拔、离子含量、电导率的单位分别为:cm、m、AD、°东经、°北纬、m、mg/L、μS/cm。 硅藻样品采自青藏高原共约90个湖泊,经度范围为84.528-102.360°E,纬度范围为28.148-38.897°N;海拔:2797-5180m。
羊向东
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