该数据集包括青藏高原阿木错(AMC)、班戈错(BGC)、帕隆4号冰川(PL4)、玉珠峰冰芯(YZF)的可培养细菌菌落图片,可以体现菌落的颜色、透明度等基本信息。附有一个表格信息,包括菌落来源地的经纬度,水深及颜色等。 这些细菌从青藏高原冰雪、湖水等生境中分离得到,菌落表现出不同的颜色,这可能与细菌适应青藏高原强辐射、低温、寡营养的环境有关,通过不同的色素产能等来适应恶劣环境。菌落是通过湖水平板涂布,在低温(4℃)培养(培养基为R2A等)分离,确定无污染、为单菌落之后获得。得到的单菌落后续会进行16S rRNA全长测序,通过97%的相似度确定其是否为新的种;如果该序列与最相似菌株的序列相似度低于97%,会进行全基因组测区,确定该菌株在相应的属、科甚至门类中的系统发育关系,确定该菌株是否具有新的发育地位,补充青藏高原湖泊微生物多样性。
刘勇勤
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