为研究日喀则藏族人群的父系遗传结构,我们采集了434个日喀则藏族个体。首先,通过SNP分型的方法,确定了每个样本的单倍群归属。其次,采用ABI 3130XL,用荧光标记引物对8个STR位点进行检测,以进一步研究该人群的Y染色体遗传多样性。结果表明,日喀则藏族人群中的O-M175频率最高(47.00%,其中O2-M122最多(41.47%)),其次是D-M174(40.78%,以D-P47(20.97%)和D-N1(16.82%)为主)。此外,还有C-M217(1.84%),R1a1- M17(1.61%),N1-LLY22G(5.76%),Q-M242(0.69%),以及E、J、K-M、T等。本数据及和去年发布的拉萨藏族Y染色体数据相整合,能够实现不同藏族人群的遗传结构的比较,进而通过系统发育以及溯祖分析,能够揭示不同藏族人群的群体历史。
孔庆鹏, 祁学斌
我们获得了30个藏族个体的全基因组变异数据开展研究,采用DNA 微阵列(DNA Array)的方法,对30个样本进行了SNP分型检测,获得每个样品约70万位点(包括核基因组、线粒体DNA和Y染色体)分型结果。首先,在提取基因组DNA后,进行DNA扩增、酶促片段化、沉淀和重悬。随后样品过夜孵育过程中和BeadChip杂交,DNA经退火得到位点特异性的50-mer探针,与某种Infinium微珠类型共价偶联。然后采用Infinium XT继续酶基延伸赋予等位基因特异性,然后进行荧光染色。采用iScan系统检测微珠的荧光其强度,Illumina软件自动执行分析和基因型识别。最后得出每个样本的SNP分型结果。基于上述数据,进行相关生物信息分析(主要包括芯片位点质控分析、Y染色体和线粒体DNA的单倍群分型分析)。结合上年度的数据,有助于从核基因组、Y染色体和线粒体DNA的角度,解析藏族人群的遗传结构,通过与高原周边人群数据的比较,可以较为全面地追溯高原人群的迁徙和定居历史。
孔庆鹏
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