采用样点法对岗日嘎布山沿海拔梯度的鸟类进行调查，按400米海拔跨度对考察区域分别设置海拔带，北坡从波密县通麦镇至嘎隆寺，由低到高设置了5个海拔带，南坡从墨脱县背崩乡解放大桥至嘎隆拉，由低到高设置了8个海拔带，获取岗日嘎布西北段南北坡鸟类多样性和分布数据，以期对理解这一区域鸟类多样性的形成和维持机制方面取得重大突破，进一步探讨气候变化对鸟类多样性的影响与适应策略、物种多样性对全球变化的响应与保护策略等关键科学问题。
杨晓君
2020年11月，利用网捕法和电捕法采集了青海省青藏高原鱼类，采样区域包含了青海省主要水系。共采集了30个样点，其中12个样点，采集到了鱼类标本685尾，包括高原鳅属裂腹鱼类。本项工作是“建立青藏高原湖泊系统水生生物检测方法”计划中的一个环节，即采用传统的鱼类调查数据以生成湖泊系统的物种列表，后将以此结合高原台面多个湖泊系统的环境水样所获取的高通量分子数据，并测试可视参数（湖泊大小、隔离、地理位置和光谱特性）是否能用于预测水生生物多样性。
刘淑伟
采用夹捕、笼捕和陷阱法调查非飞行小型兽类多样性与垂直分布格局。采用红外相机调查法获取地栖大中型野生动物的出现数据。小型兽类调查累计采集日数达8000个，采集标本526号，组织样品1052份；红外相机调查获得野生动物照片4218张，记录到大中型哺乳动物25种。小型兽类数据包含物种、多度、体重等性状数据、环境梯度数据等，可为理解环境梯度-物种多度-物种性状间的关联及垂直梯度哺乳动物群落构建的生态过程提供数据支撑。红外相机数据主要收集珍稀濒危野生动物的出现数据，可补充区域生物多样性本底，同时为生物多样性热点区及保护关键区识别提供科学依据。
李学友
数据主要包括“一带一路”沿线国家和重点区域的旗舰物种的面（POLYGON）、点（POINT）位分布，数据来源IUCN、GIBF。分布图制作的基础数据底图来源于ArcOnline地图下载。本数据主要用于分析“一带一路”重点区域旗舰物种的空间布局。 1）数据内容：本数据集按“一带一路”重点区域（中亚大湖区、中巴经济走廊、三江源国家公园）旗舰物种分布集成，其中哺乳动物9种、高等植物与真菌15种、鸟类20种、鱼类3种。 2）数据来源及加工方法：基于“一带一路”重点区域的旗舰物种名录及其分布基础数据：包括IUCN红色名录以及GBIF的物种地理空间数据，运用AcrMap软件制作每个物种的分布图，形成图集。 3）数据质量描述：每个物种经严格的文献调查、野外调查等，确定旗舰标准，并经哺乳动物学专家、高等植物学与真菌学专家、鸟类学专家、鱼类学专家，按“旗舰物遴选标准（6个指标中，应至少同时具有其中4个指标）”原则严格筛查打分，遴选出评分＞25分的物种进行图集制作。每个物种的地理空间数据的经纬度信息经专业人员核对，并按统一的制图标准制作出图。 4）数据应用成果及前景：考察了“一带一路”重点区域旗舰物种的生存状况、生态价值、人文经济价值等，为“泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设”地区的生态多样性评估和生态保护提供科学依据。
王雨华, 张元明, 杨维康, 陈毅峰, 屈延华, 陈世龙, 庄会富, 王亚楠, 林紫红
数据主要包括“一带一路”沿线国家和重点区域的旗舰物种的面（POLYGON）、点（POINT）位分布，数据来源IUCN、GIBF。分布图制作的基础数据底图来源于ArcOnline地图下载。本数据主要用于分析“一带一路”沿线国家旗舰物种的空间布局。 1）数据内容：本数据集按“一带一路”沿线8个国家（巴基斯坦、尼泊尔、伊朗、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、乌兹别克斯坦、塔吉克斯坦、缅甸）旗舰物种分布集成，其中哺乳动物12种、高等植物1种、鸟类23种、鱼类9种。 2）数据来源及加工方法：基于“一带一路”沿线国家的旗舰物种名录及其分布基础数据：包括IUCN红色名录以及GBIF的物种地理空间数据，运用AcrMap软件制作每个物种的分布图，形成图集。 3）数据质量描述：每个物种经严格的文献调查、野外调查等，确定旗舰标准，并经哺乳动物学专家、高等植物学与真菌学专家、鸟类学专家、鱼类学专家，按“旗舰物遴选标准（6个指标中，应至少同时具有其中4个指标）”原则严格筛查打分，遴选出评分＞25分的物种进行图集制作。每个物种的地理空间数据的经纬度信息经专业人员核对，并按统一的制图标准制作出图。 4）数据应用成果及前景：考察了“一带一路”沿线8个国家旗舰物种的生存状况、生态价值、人文经济价值等，为“泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设”地区的生态多样性评估和生态保护提供科学依据。
王雨华, 张元明, 杨维康, 陈毅峰, 屈延华, 陈世龙, 庄会富, 王亚楠, 林紫红
班戈、伦坡拉地点的化石研究意义重大，化石的年代数据不可或缺。该地区发育有火山凝灰岩，其中的锆石可用来做U-Pb年龄分析，以此来判断地层及化石的年龄。本数据以图示的方式展示班戈、伦坡拉化石地点凝灰岩样品中的锆石U-Pb年龄分析结果，图中标明了大量锆石的外形，并在不同的锆石样品上标明了年龄分析结果，数据展示了相关研究所采用的较大的样本量，分析结果也较清晰。本数据的图片展示直观清楚，结果可靠，对青藏高原的研究有着较为重大的意义。
孙博阳
1）数据内容：塔里木盆地沙蜥属和麻蜥属物种名录及其分布数据，包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、市县分布地；2）数据来源及加工方法：基于2008至2020年间对塔里木盆地干旱荒漠区两栖爬行动物野外科考，记录该地区沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种组成和分布范围；3）数据质量描述：标本的调查、采集和鉴定人员均为专业人员，样品的采集信息经过核对，确保分布数据的质量；4）数据应用成果及前景：综合分析塔里木盆地沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种多样性和分布数据，可以为为亚洲中部干旱区生物多样性编目提供重要资料，为评估生物多样性格局及制定保护策略提供科学依据。
郭宪光
2020年4月至2020年8月子子课题3采集了分布于青海省海西蒙古族藏族自治州州海晏县的青海细毛羊耳组织样品51份、海南藏族自治州同德县的欧拉羊血液样品50份、海南藏族自治州同德县的牦牛血液样品50份、西宁市大通回族土族自治县的海东驴血液样品60份，组织样品共计211份。同时，记录了个体的体长、体高、体重、年龄、性别等信息，以及产羔数、毛细度、毛长等经济性状数据，拍摄了个体照片，并通过问卷调查的方式获得了饲养方式、疫病情况等信息。
田菲
为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原，探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系，2018年6月，课题组利用三代基因组测序技术，对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装，得到组装基因组大小为409.69 Mb，Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时，这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响，以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。
段元文
2018年产生的蔓菁基因组序列，经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体，并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向，为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组（Group）中，并且确定每一群组中所有序列的顺序（Order）及方向（Orientation），之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列（EST序列）、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。
段元文
为描述青藏高原及周边地区（泛第三极地区）主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景。2020年我们对201个全球家鸡血液、组织等DNA组织样品提取总DNA后建库并做全基因组测序，同时下载已公布家鸡基因组数据一共863个家鸡基因组开展群体分析，为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据，并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集相关文章已发表，本数据集内所有数据提供fastq,bam,vcf,snp文件在线下载。
彭旻晟
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2019年12月集中在重庆、山东、江苏、海南地区共采集重庆大足黑山羊、鲁北白山羊、海南黑山羊、徐州苏白山羊、沂蒙黑山羊共5个地方品种共254只山羊共1208份血液或组织样品，其中9只山羊心肝脾肺肾等新鲜组织RNA样品。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。本数据集还包含品种代表个体外观照片，以jpg格式存储。
彭旻晟
1）数据内容：青藏高原气候变化背景下钩虾预测图；2）数据来源及加工方法：基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库：包括经纬度、海拔，运用ArcView、Maxent软件制作青藏高原钩虾现在、Mid-Holocene和LGM时期预测图；3）数据质量描述：样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对，确保分布数据的质量，分析人员均经过实验室的严格培训；4）数据应用成果及前景：综合分析西藏地区钩虾分布数据、物种多样性和遗传多样性，从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应，为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
为研究蔓菁的扩散与人类活动之间的关系，我们将来自青藏高原及周边区域，以及巴基斯坦，印度，尼泊尔，德国，日本等地的蔓菁品种进行重测序，同时对基因家族进行聚类，以及特有、共有基因和基因家族统计，此外还将进行基因家族扩张收缩分析，系统发育树的构建，全基因组复制事件等分析。目的是解析人类活动和区域气候环境双重压力下，高原各地的传统蔓菁品种适应高原的分子基础。因此这项研究有助于揭示蔓菁适应高原生态环境的适应性机制以及在进化过程中人工驯化和人类选择对其遗传分化的影响。
段元文
数据内容：包含青藏高原湖泊采集点，钩虾遗传多样性图，项目对青藏高原及其周边地区620个溪流湖泊开展钩虾样品采集并开展了遗传多样性研究，以期为青藏高原湖泊水资源和生物多样性保护提供基础资料。 数据来源及加工方法：本数据集为第一手数据，自主产生。本数据集中标本采集点为项目组2017至2020年在青藏高原开展了4次采集考察所获得。分子数据是对采集标本提取COI序列，作为分子证据，开展遗传多样性分析；主要仪器为PCR仪，型号为Mastercycler X50s，厂家为eppendorf。 数据质量描述：数据集基本覆盖了青藏高原，并增加青藏高原周边地区的样品。 数据应用成果及前景：为生物多样性保护提供基础数据。
侯仲娥
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2020年集中在新疆维吾尔自治区伊犁地区共采集209个共707份当地主要驯化动物血液或、组织、粪便样品，其中包括12匹马心肝脾肺肾等RNA样品。本数据集包含新疆伊犁地区绵羊、家马、黄牛、家犬、家鸡、家鹅、山羊等物种的物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。本数据集还包含采样个体外观照片，以jpg格式存储。
徐峰
为描述青藏高原及周边地区（泛第三极地区）主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景。2020年我们选取31个肯尼亚当地商品鸡和土鸡肾、脾、空肠RNA组织样品，提取总RNA后建库并做转录组测序。测序产生了一批180G转录组测序原始数据。为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据，并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集包含31个家鸡个体物种、品种、性别、表型等基本样品信息excel表，和31个家鸡个体3种组织转录组测序原始数据及MD5值。
彭旻晟
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2019年集中在西藏自治区林芝地区察隅县共采集187份当地主要驯化动物样血液或、组织、粪便等品。本数据集包含西藏林芝察隅县家鸡、家猪、黄牛、家马、家犬、犏牛等的物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。本数据集还包含采样个体外观照片，以jpg格式存储。
彭旻晟, 尹婷婷
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物疾病情况，调查青藏高原主要家养动物的疫病情况，对各主要家养动物的主要流行疾病进行抗病和易感个体的遗传样本及肠道微生物样品的采集工作。我们在青海省海西蒙古族藏族自治州乌兰县漠河骆驼场采集骆驼粪便。本数据集是青海省骆驼的肠道微生物16srRNA测序数据。通过提取骆驼粪便的微生物总DNA，设计引物扩增细菌的V3-V4区基因片段，再进行二代高通量测序得到相应数据。本数据集共测序44份样品。本数据集可应用于挖掘抗病个体基因层面的遗传资源，找到相应的候选基因。
段子渊
本数据为2018年哈萨克斯坦首都努尔苏丹生态屏障空间分布图，图中的地物类型主要包括防护林、道路、建筑、湖泊以及河流等。数据源为2018年8月的四景哨兵影像，分辨率为10米。同时，叠加OpenStreetMap（OSM）全球地物矢量图。该数据集经过校正处理，较为准确。防护林斑的提取通过目视解译与实地野外调查相结合，精度较高。数据反映了哈萨克斯坦首都努尔苏丹城市生态屏障空间分布现状，同时，对于长时间的防护林时空格局的变化监测，也具有重要的参考价值。
王永东
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0931-4967287
poles@itpcas.ac.cn
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