1) 数据内容：2021年青藏高原为中心的泛第三极钩虾物种多样性比较分析结果；2) 数据来源及加工方法：基于青藏高原及其周边地区567条遗传数据运用BEAST软件构建系统发育树；基于青藏高原3180条分布数据，包括经纬度、海拔，运用ArcView、Maxent软件构建LGM、Mid-Holocene、现在、和未来时期的预测分布图；3) 数据质量描述：样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对，确保分布数据的质量，分析人员均进过实验室的严格培训；4) 数据应用成果及前景：发现以青藏高原为核心的泛第三极包括丰富的钩虾物种多样性，但大多数物种还没有正式描记和发表，有待下一步工作的开展。该研究为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
兴都库什山脉（Hindu kush Mountains）是亚洲中部的高大山脉。平均海拔约5000米，最高峰蒂里奇米尔峰海拔7690米，是发源于青藏高原西南部的印度河和发源于帕米尔高原的阿姆河的分水岭。研究该区域人群的遗传结构，有助于深入理解该地区人群的扩散历史和适应高原环境的遗传基础。在本研究中，我们对分布于兴都库什山脉的5个群体的213个个体进行了母系遗传结构的研究。采用线粒体基因组捕获建库和二代测序（Illumina HiSeq X Ten platform）的方法，获得了213个个体的线粒体全基因组序列（平均深度>1000x）。基于系统发育思想，我们对这些数据进行质量控制，确保没有样本污染等质量问题。以修订后的剑桥标准序列参考，进行突变位点的输出。根据世界范围内的人群的线粒体DNA系统发育树（PhyloTree.org），对每个样本进行单倍型类群划分。综合以往发表的现代人群和古代样本的mtDNA数据，系统研究了该地区人群的起源和扩散历史。结果表明，该地区的印欧语系人群的主要母系遗传组分来源于欧亚西部。单倍群W3a1a和J1b1a1等类群可能与印欧语系人群的迁徙有关，说明印欧语系向南亚的扩散可能不仅仅是简单的文化扩张，也伴随着一部分的人群迁徙。此外，研究还表明，巴基斯坦北部可能在印欧语系向南亚的扩散中起着重要的通道作用。
孔庆鹏
本数据集包含三台部署在东北虎豹国家公园的陆生脊椎动物红外相机及环境参量观测数据集。本设备部署在东北虎豹国家公园的两个地点，时间跨度（2020.8-2021.6）。由于设备维护，光照不足等，部分数据不连续，但三台设备的数据可互为补充，可重建出2020.8-2021.6虎豹国家公园内观测点的全部信息。 三台设备中，有两台设备配备了红外相机，分别采集到216张照片及1239张照片，可与上述传感器照片相互匹配后，获得拍照前后的生态因子信息。 1. 虎豹国家公园林区出没的野生动物以及温度、湿度、光照、压强以及网络信号强度信息。采集间隔每半小时一次； 2. 数据来源："陆生脊椎动物监测设备研制“课题，2016YFC0500104，完成单位：中国科学院动物研究所，原始数据，未加工； 3. 传感器数据采集间隔每半小时一次，温度精度正负0.1度，湿度精度正负0.5%，照片数据分为触发和定时两种，触发数据一般由出没在红外相机视野内的野生动物触发；定时拍照数据根据电池电量情况动态调节，采集间隔在1-12小时之间； 4. 本数据可用于记录保护区内的环境温度，结合红外相机数据，可用于分析野生动物活动节律，共存分析以及分布的限制因子等。
乔慧捷
本数据集包含两台部署在祁连山保护区的陆生脊椎动物红外相机及环境参量数据集。本设备部署在祁连山保护区寺大隆附近，时间跨度（2020.8-2021.10）。由于设备维护，光照不足等，部分数据不连续，但两台设备的数据可互为补充，可以重建出2020.8-2021.10祁连山保护区内观测点的全部信息。 两台设备有一台设备配备了红外相机，采集到4994张照片，可与上述传感器照片相互匹配后，或者拍照前后的生态因子信息。由于单个压缩文件较大，故采用分卷压缩，需要将三个压缩文件都下载后方可解压缩。 1. 祁连山保护区内出没的野生动物以及温度、湿度、光照、压强以及网络信号强度信息。采集间隔每半小时一次； 2. 数据来源："陆生脊椎动物监测设备研制“课题，2016YFC0500104，完成单位：中国科学院动物研究所，原始数据，未加工； 3. 传感器数据采集间隔每半小时一次，温度精度正负0.1度，湿度精度正负0.5%，照片数据分为触发和定时两种，触发数据一般由出没在红外相机视野内的野生动物触发；定时拍照数据根据电池电量情况动态调节，采集间隔在1-12小时之间； 4. 本数据可用于记录保护区内的环境温度，结合红外相机数据，可用于分析野生动物活动节律，共存分析以及分布的限制因子等。
乔慧捷
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2021年5月子子课题3在甘肃省白银市靖远县开展家养动物遗传资源调查与采集工作。本次科考共采集当地滩羊耳组织156份、山羊耳组织44份、藏羊耳组织25份，共计225份。同时记录了个体的体长、体高、体重、出生日期、采集日期、年龄、性别等信息，拍摄了个体照片，并通过问卷调查的方式获得了饲养方式、饲养食物情况等信息。
田菲
西藏自治区生态资源消耗数据集包括省级-市级-县级三个尺度的2000-2019年生态资源消耗数据，根据西藏自治区实际情况，生态资源消耗主要指农牧业生产活动中消耗的生态资源量。生态资源消耗量计算是基于粮食产量数据、牲畜存栏量数据和畜产品产量数据，结合人类占用净初级生产力（HANPP）的评估方法，将生物量数据转换为碳含量数据，进而测算出生态资源消耗量。生态资源消耗量数据是生态压力与生态承载力研究的基础数据，可以直接揭示人类农牧业生产活动对生态系统带来的压力。
闫慧敏
为收集青藏高原特殊种质资源，并挖掘影响特殊种质资源的分子标记，依据遗传标记信息，选择具有优异位点的个体绵羊进行标记辅助选择、扩繁和世代选育，培育特殊种质资源的家系。2021年本子课题（2019QZKK05010704）在青海海北广泛收集青海藏羊和青海细毛羊样品，在乐都农业试验站及青海省三角城种羊场继续组建并扩充第一、二核心群。本数据集包含1050份组织样本基本信息，包括品种、采集地、采集时间、性别、组织类型、保存方法等。
赵凯
为解析大额牛基因组特征、驯化以及种群历史、种群遗传多样性特征、种群分化特征，以及大额牛优秀肉质经济性状的遗传基础，2021年本子课题（2019QZKK05010703）在云南省昆明市、文山苗族自治州调查独龙牛、高峰牛遗传资源，采集心肝脾肺肾各脏器组织样品。为大额牛种质资源的保护、开发和利用提供科学理论参考，促进我国高端肉牛产业的发展。 本数据集包含个体照片、组织样品信息表，信息表记录品种、采集地、采集时间、样品类型、取样部位等基本信息。
李艳
为掌握高原农牧象虫以及相关鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫物种组成、区系特点及寄主信息，建立高原农牧天敌昆虫的DNA条形码快速鉴定体系，评估天敌资源现状，提出天敌昆虫可持续利用建议。子课题2019QZKK05010606在青藏高原开展重点农牧区、大宗作物相关象虫以及鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫资源调查，天敌昆虫物种多样性数据库建设，天敌资源现状评估和可持续利用评估。2020年期间西藏自治区、云南省农牧交错区、农林交错区，农区与牧区腹地，开展农牧鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫关键类群调查，进行标本采集、样品采集，生物学信息与生态环境信息收集等，按照标准和规范系统整理天敌昆虫标本，并有效保藏，开展物种形态鉴定并获取DNA条形码信息，整合物种地理分布、寄主信息、生态图片等信息，构建天敌物种多样性信息库；对天敌资源现状进行评估并提出可持续利用的建议。
刘宁
为掌握高原农牧象虫以及相关鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫物种组成、区系特点及寄主信息，建立高原农牧天敌昆虫的DNA条形码快速鉴定体系，评估天敌资源现状，提出天敌昆虫可持续利用建议。子课题2019QZKK05010601在青藏高原开展重点农牧区、大宗作物相关象虫以及鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫资源调查，天敌昆虫物种多样性数据库建设，天敌资源现状评估和可持续利用评估。2020年期间西藏自治区、云南省农牧交错区、农林交错区，农区与牧区腹地，开展农牧鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫关键类群调查，进行标本采集、样品采集，生物学信息与生态环境信息收集等，按照标准和规范系统整理天敌昆虫标本，并有效保藏，开展物种形态鉴定并获取DNA条形码信息，整合物种地理分布、寄主信息、生态图片等信息，构建天敌物种多样性信息库；对天敌资源现状进行评估并提出可持续利用的建议。
乔格侠
子课题（2019QZKK05010411）以野牦牛、藏羚和棕熊种群调查监测为核心内容，开展系统而持续的野外考察工作，查清它们的地理分布、种群数量、种群结构等，开展适宜栖息地评估。分别选取其分布区和潜在分布区，划分为多个子区域，根据生境类型、气候、海拔等因素采用分层随机抽样，分别采用总体计数法、可变距离样线法或固定宽度样线法进行考察。同时针对棕熊的极低遇见率，结合访谈法进行。考察区域主要包括青海省玉树藏族自治州、海西蒙古族藏族自治州、海北藏族自治州和其他州县该三种动物的分布区和潜在分布区，以期掌握青海省境内的野牦牛、藏羚、棕熊分布和五年的种群动态情况。本数据集包含2021年在青海调查牦牛、藏羚和棕熊拍摄的照片和视频。
陈振宁
为描述青藏高原重要啮齿动物遗传多样性分布格局，厘清其相关遗传背景，分析其在全球气候变化的大背景下种群波动规律及其影响因素，分析高原鼠兔对鸟类的影响和在维持生态系统稳定性中的意义，为探讨高原物种的适应与进化机制、构建种群暴发预测预警体系，正确认识高原鼠兔在生态系统中的地位和作用，提出及时有效的种群管理对策具有重要的理论和实践意义。子课题（2019QZKK05010410）2021年集中在青海海西蒙古藏族自治州、果洛州、海南州调查高原鼠兔，共采集200份高原鼠兔脾、肺等组织样品。本数据集包含1个样品信息表，照片。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。
曲家鹏
利用卫星追踪技术，子课题（2019QZKK05010409）对黑颈鹤中部越冬种群开展追踪工作。通过脚扣法捕捉黑颈鹤后，我们采取脚环式方法固定追踪器，大大提高了追踪的成果率以及获取的数据量。电量理想的情况下，采样频率可以加快到半个小时一个点。获取更精细的追踪数据。相关结果，显示黑颈鹤对越冬地的选择具有高度的稳定性，初步的分析发现黑颈鹤的越冬地和繁殖地之间，具有强连接线，但也存在着幼体在不同度夏地活动的特征。强的迁徙连接性，预示着黑颈鹤更容易受到环境改变的伤害。本数据集包含黑颈鹤生境照200张、黑颈鹤幼鸟活动数据1276条。黑颈鹤幼年个体卫星追踪数据信息表记录经纬度、日期、高度、速度、温度等信息。
伍和启
高原鼢鼠和高原鼠兔是广泛分布于青藏高原及周边平原地区的特有种和关键物种，不同的地理位置和生态环境造成了多样化的物种形成。这些物种的起源和演化的研究还有待完善。同时，它们的地理分布和形态特征是很好的研究高原适应和适应性进化的材料，比较高原与其他低海拔平原近缘种的基因组、转录组和表观遗传组学的分析，能够帮助解析高原适应的机制，初步探索表观修饰在高原适应中发挥作用的机制。2021年集中在青海省共采集16个动物的组织样本共计112份。本数据集包含一个样品信息表，样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。为探讨高原旗舰物种的高原适应性进化问题，对青海玛多县和拉脊山地区16个高原鼢鼠、鼠兔个体开展ChIP-seq测序转录组测序，每个个体产生15Gb数据，共600Gb。数据以fastq格式存储。
吕雪梅
为评估家栖鼠类对青藏高原生物多样性和人们生产生活的危害，评估后续潜在生态影响和风险，为制定更加科学有效的生物防控和生态保护措施提供全新的依据。子课题（2019QZKK05010303）2021年在西藏拉萨、青海海西州、四川成都调查高原境内家栖鼠类物种组成、种群特征、分布范围进行全面的实地调查，并采集家栖鼠类样品。共采集80份大家鼠、小家鼠组织样品。本数据集包含1个组织样品信息表，记录采集地、采集时间、物种、样品类型等信息。
靖美东
为描述青藏高原两栖爬行动物分布和外来动物造成的危害，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2021年子课题（2019QZKK05010302）集中在西藏自治区昌都地区及周边共采集30份美洲牛蛙、泽陆蛙、多疣狭口蛙种质资源。本数据集包含1个标本信息表、1个组织样品信息表、生境照、标本照。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。
李义明
本子课题（2019QZKK05010217）拟选择对环境变化极为敏感的外温脊椎动物——青海沙蜥为代表，通过野外调查，比较青藏高原及邻近地区不同海拔青海沙蜥种群的形态、生理和生活史的差异，分析青海沙蜥对青藏高原环境变化的响应和适应特征，结合物种分布模型（SDM）和机制模型预测青海沙蜥未来的受胁程度，提出气候变暖背景下青藏高原青海沙蜥多样性的保护对策，为环境变化背景下的青藏高原爬行动物多样性保护提供理论依据。本数据包含青海省共和县、海晏县、玛多县青海沙蜥生态照、生境照等照片。
杜卫国
为分析西藏地区不同种群的沙蜥对环境变化的表型与遗传适应，本子课题（2019QZKK05010216）选择依据高原内海拔梯度垂直带为主线，在红尾沙蜥分布区全境采集标本，比较该种不同种群的形态、生理和生活史的差异，分析其对环境变化的表型与遗传适应，结合物种分布模型和机制模型预测红尾沙蜥未来的受胁程度，提出气候变暖背景下高原沙蜥的保护对策，为环境变化背景下的青藏高原爬行动物多样性保护提供理论依据。于2021年在甘肃省酒泉、青海省德令哈等地区采集沙蜥样品资源。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。照片，以jpg格式存储。
计翔
为了确定高原林蛙在青海沿纬度梯度的分布点以及生境类型，2021年集中在青海海东市民和县、海南藏族自治州共和县以及果洛州玛沁县等地区共采集高原林蛙分布点数据8个，海拔覆盖2000-3800m。本数据集包含1个坐标信息表和57张生境照片。坐标信息表包含编号、记录日期、时间、天气、坐标经纬度、海拔样、生境类型及代表生境照片编号等信息。为揭示气候变化对未来青藏高原高原林蛙多样性的影响，通过热生理学指标和环境有效温度等数据计算不同地理种群高原林蛙热安全阈度（thermal safety margin），评估不同地理种群高原林蛙受气候变暖受胁程度。本数据集包括高原林蛙四个海拔种群野外活动体温、静息代谢率、环境温度和形态数据，补充了2000m海拔种群的选择体温、耐受温度和温度校正数据。数据以excel格式存储。为研究不同海拔高原林蛙遗传多样性的差异，基于4个线粒体基因 (12S rRNA、16S rRNA、COI和Cytb) 序列，对采自青藏高原4个海拔梯度 (2000 m、2600 m、3200 m和3800 m)高原林蛙共计100个样本进行测序分析，以期为该物种的保护提供科学依据，本数据包括高原林蛙三个海拔种群12S rRNA、16S rRNA、COI和Cytb四个基因测序所得序列数据，补充了2000m海拔种群的四个基因序列数据。
张永普
为描述青藏高原小型哺乳动物环境变化和人为干扰对其时空分布影响，利用统计学模型，以及用分子技术手段明确不同海拔梯度小型哺乳动物种类。2021年在青海省的西海镇、刚察县、德令哈市等8个地区共采集105份高原鼠兔、子午沙鼠、三趾跳鼠、五趾跳鼠、青海松田鼠等小型哺乳动物资源，实体样品包括动物实体标本和肌肉、心、肝、脾、肺、肾、胰、膀胱、睾丸、卵巢。本数据集包含1个标本信息表、1个组织样品信息表和对应每个标本的1张照片。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。照片，以jpg格式存储。
侯祥
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