为研究青藏高原及周边地区主要马属驯化动物的群体演化历史和局部适应遗传机制,并建立相应的种质遗传资源库。我们对在青海省、西藏自治区、新疆自治区采集的青藏高原及周边地区的马属样本进行测序:包括藏家驴、平原家驴等品种。测序包括denove和重测序数据,为追溯该地区主要马属驯化动物的驯化、迁徙、扩张等群体历史事件,并进一步探讨马属动物对缺氧、高寒、干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。同时,对家驴各组织进行测序,测序包括HIFI基因组数据、HiC基因组数据,为组装完整的驴的基因组做准备,便于后续分析。
李艳
为全面贯彻《科学数据管理办法》中针对“政府预算资金资助形成的科学数据应当按照开放为常态、不开放为例外的原则,由主管部门组织编制科学数据资源目录,有关目录和数据应及时接入国家数据共享交换平台,面向社会和相关部门开放共享,畅通科学数据军民共享渠道”的精神,依据相关汇交标准规范的有关要求,现面向第二次青藏高原综合科学考察研究项目建立本规范。 本规范主要起草单位:中国科学院地理科学与资源研究所。 本规范主要起草人:第二次青藏高原综合科学考察研究任务九项目组。
杨雅萍
日志、影像是野外科考特有的、重要的一手资料,也是科学数据的重要组成部分。为了进一步规范第二次青藏高原综合科学考察研究项目的考察日志、影像资料的收集整理和入库汇交,确保考察日志、影像资料入库的可操作性、条理性、规范性,特制定本技术规范。 本规范规定了考察日志、影像资料收集整理的程序、方法,包括工作准备、野外调查、资料整理等要求,以期能更好的为考察数据资料入库服务。 本规范适用于第二次青藏高原综合科学考察研究项目组织的野外考察调查的日志、影像资料的整理入库,其他野外科考形成的相关资料也可参照本技术规范执行。
杨雅萍
本数据集为祁连山区域2021年的30m土地覆盖分类产品。该产品以2021年的土地覆盖分类产品为基础,基于Google Earth Engine平台的Landsat系列数据和强大地数据处理能力,利用变化检测的思想和方法生产得到,总体精度优于85%。该产品是1985-2020年土地覆盖分类产品的延续。1985-2020年的土地覆盖分类产品也可在本网站下载得到。其中,1985-2015年的土地利用产品为5年1期,2015-2021年的土地利用产品为1年1期。
杨爱霞, 仲波, 角坤升, 吴俊君
该数据为川藏线及周边地区1:25万社会经济数据,包含GDP、人口等数据。人口和GDP是社会经济发展、区域规划和资源环境保护的重要指标之一,通常以行政区为基本统计单元。人口和GDP空间化以空间统计单元代替传统的行政统计单元,为多领域之间数据共享、进行空间统计分析带来极大便利。数据来源于资源环境科学与数据中心中国人口和GDP空间分布公里网格数据集。由资源环境科学与数据中心中国人口和GDP空间分布公里网格数据集按川藏铁路沿线及周边地区范围裁剪得到。数据为栅格格式,精确至每平方公里,适用于川藏线及周边地区,人口和GDP是社会经济发展、区域规划和资源环境保护的重要指标之一。
王中根
川藏铁路沿线洪水风险评估数据,包括自然指标、危险性、脆弱性和风险评估数据。数据来源:从地球大数据科学工程网站获取;根据USGS下载的DEM计算获取。加工方法:五年一遇最大24h降水通过根据评估区域内逐年最大24h降水序列进行频率计算获得;河网指数根据评估区域内海河版六级水网裁剪并处理获得;危险性将五年一遇最大24h降水和河网指数赋值计算获取;脆弱性将人口密度、交通造价、GDP总量数据赋权计算获得;风险数据根据危险性和脆弱性赋权计算获得。制定数字加工操作规范。加工过程中,规定操作人员严格遵守操作规范,同时由专人负责质量审查。经多人复查审核,其数据完整性、逻辑一致性、位置精度、属性精度、接边精度、现势性均符合国家测绘局制定的有关技术规定和标准的要求,质量优良可靠。
王中根
为描述青藏高原重要啮齿动物遗传多样性分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年本子课题(2019QZKK05010410)集中在青海海西蒙古藏族自治州、果洛州、海南州开展高原鼠兔调查,共采集200份高原鼠兔样品,实体样品为脾、肺组织。本数据集包含1个样品信息表和生境照、工作照、工作视频。样品信息表包含物种、性别、详细采样地、海拔、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
曲家鹏
为描述青藏高原高原鼠兔种质资源遗传多样性分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年子课题(2019QZKK05010209)集中在青海省(海西蒙古族藏族自治州,格尔木市,昆仑山口;海西蒙古族藏族自治州,都兰县,香日德镇,沟里乡;果洛藏族自治州,玛多县;果洛藏族自治州,玛沁县,大武镇;黄南藏族自治州,泽库县;海南藏族自治州,贵南县,塔秀乡)不同海拔区域采集93份高原鼠兔种质资源,实体样品包括血液或、组织、粪便等。本数据集包含1个样品信息表。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
张良志
1990-2020年 中蒙俄经济走廊公路、铁路、管线空间分布图 1)1990年公路、铁路、管线空间数据;2015年中蒙俄经济走廊公路、铁路、管线空间数据;2020年中蒙俄经济走廊公路、铁路、管线空间数据; 2)在NASA网站下载中蒙俄经济走廊范围内的遥感影像,用ARCGIS10.2软件人工解译提取公路、铁路;地图要素借助俄罗斯地图册标注;管线数据参考相关地图人工标注 ; 3)图件集比例尺为1:2500000,清晰反映了近30年来中蒙俄经济走廊交通及管线变化情况; 4)数据详细显示了近30年来中蒙俄经济走廊交通及管线的变化情况,为后期研究交通及管线建设对生态环境变化研究提供数据基础。
卜晓燕
本数据集包括了中蒙俄经济走廊区1982-2015年最大归一化植被指数(NDVI)数据,2000-2020年最大增强型植被指数(EVI)数据,以及2001-2019年土地覆被利用变化数据(LUCC)。其中,NDVI数据提取自GIMMS卫星数据,分辨率为8km;EVI和LUCC数据提取自MODIS卫星数据(MOD13A3和MCD12C1),分辨率分别为1km和5km。数据集过滤了MODIS卫星数据中原本存在的异常值或缺测值,相比源数据质量更高。其中,使用最大值提取法处理NDVI和EVI数据,得到年最大NDVI和EVI,可以更好地反应研究区的植被分布及变化情况。基于卫星遥感数据的植被和土地利用变化,可以为中蒙俄经济走廊生态环境风险防控提供数据支撑。
张雪芹
为整合泛第三极家鸡数据,建设“全球家鸡基因组数据库(Chicken2K)”,为国际家鸡起源驯化选择研究提供基础数据,为家鸡新品种选育改良提供科学指导。2022年本子课题与中国西南野生生物种质资源库(动物种质资源库)合作,申请使用库内近年采集保藏的东南亚地区家养动物遗传样本,挑选代表性个体开展遗传多样性评估。本数据集包含动物种质资源库馆藏的东南亚国家(老挝、泰国、缅甸、越南)家鸡及红原鸡血液、组织样品信息共224份。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
彭旻晟
生物多样性(biodiversity)是生物及其环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态过程的总和,表现在生命系统的各个组织水平上,包括遗传多样性、物种多样性以及生态系统多样性三个层次。生境质量越高,生物栖息地环境越好,生物多样性越高,在部分研究中采用生境质量指数来表征生物多样性(肖强 et al. 2014)。生境质量指数(Habitat Quality,HQ)是对区域土地利用类型的生境适宜性和生境退化程度状况进行评价的一个无量纲综合性指标,以耕地、道路、城镇和河流作为生境胁迫因子,打分形成敏感性参数。针对生物多样性产品生产,基于土地利用数据和InVEST模型进行了国家屏障区生态系统生物多样性建模研究。InVEST模型具有输入数据量少、导出数据量大、对抽象生态系统服务功能进行定量分析等优点,是当前生物多样性评估的重要手段。基于青藏高原地区土地利用的实际情况,选取水田、旱地、城镇用地、农村居民点和其他建设用地这5种人类活动影响极大的土地利用类型作为威胁因子。将土地利用数据作为InVEST模型的输入变量,基于参数化模型实现对青藏高原2000-2020年1km分辨率的陆地生物多样性估算。
王晓峰
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源,进行同质园实验获得表型数据,利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析,结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析,对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源,进行同质园实验获得表型数据,利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析,结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析,对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源,进行同质园实验获得表型数据,利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析,结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析,对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们对266个全球家鸡血液、组织等DNA组织样品提取总DNA后建库并做全基因组测序,同时下载已公布家鸡基因组数据一共863个家鸡基因组开展群体分析,为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集相关文章已发表,本数据集内所有数据提供fastq,bam,vcf,snp文件在线下载。
彭旻晟
本数据集包括藏东南地区(Southeastern Tibetan Plateau, SETP)的矢量边界以及DEM、坡度、坡向、曲率等地形数据: 1、SETP_Boundary: 以帕隆藏布流域为中心,利用周边河网(包括雅鲁藏布江、怒江、澜沧江及各自支流)划分藏东南地区。该区域包括了念青唐古拉山东段、喜马拉雅山东段及横断山的西侧部分,是我国海洋性冰川分布最为集中的地区。 2、地形数据:基于NASA Earthdata数据中心提供的NASADEM数据,拼接生成了藏东南地区的DEM、坡度(SLOPE)、坡向(ASPECT)、剖面曲率(PROFC)和水体掩膜(SWB)数据。 3、山体阴影:基于藏东南地区的NASADEM进行表面分析,生产了高度角为45°的山体阴影数据。
赵凡玉, 龙笛, 李兴东, 黄琦, 韩鹏飞
“一带一路”沿线国家水资源供给恢复力反映了沿线国家水资源供给恢复力水平,数据值越高,表明沿线国家水资源供给恢复力越强。“一带一路”沿线国家水资源供给恢复力数据产品制备,利用2000—2019年FLDAS(Famine Early Warning System Network Land Data Assimilation System)基于Noah陆面模式生产的逐年度降水量、地表径流量和地下净流量模拟数据集,在考虑逐年变化的基础上,基于敏感性和适应性分析,通过综合诊断,制备生成了水资源供给恢复力产品。“一带一路”沿线国家水资源供给恢复力数据集对分析和对比当前各国水资源供给恢复力状况具有重要参考意义。
徐新良
“一带一路”沿线国家石油保障恢复力反映了沿线国家石油保障恢复力水平,数据值越高,表明沿线国家石油保障恢复力越强。石油保障恢复力数据产品制备参考了国际能源署各国能源统计数据,利用2000-2019年“一带一路”沿线国家石油供给和消耗差值的逐年数据,在考虑逐年变化的基础上,基于敏感性和适应性分析,通过综合诊断,制备生成了石油保障恢复力产品。“一带一路”沿线国家石油保障恢复力数据集对分析和对比当前各国石油保障恢复力状况具有重要参考意义。
徐新良
“一带一路”沿线国家能源供给恢复力反映了沿线国家能源供给恢复力水平,数据值越高,表明沿线国家能源供给恢复力越强。能源供给恢复力数据产品制备参考了国际能源署各国能源统计数据,利用2000-2019年“一带一路”沿线国家煤炭、石油、天然气供给的逐年数据,在考虑各能源逐年变化的基础上,基于敏感性和适应性分析,通过综合诊断,制备生成了能源供给恢复力产品。“一带一路”沿线国家能源供给恢复力数据集对分析和对比当前各国能源供给恢复力状况具有重要参考意义。
徐新良
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