数据包括青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积物中植物DNA的原始测序文件。我们使用德国Qiagen公司的PowerMax土壤试剂盒提取DNA，并采用通用植物引物g-h (Taberlet et al., 2007) 对样品中叶绿体trnL (UAA) 内含子区的P6环进行PCR扩增，PCR产物随后送至瑞士Fasteris公司进行第二代高通量双端测序，测序仪器为Illumina NextSeq 550。数据质量分数Q30为81.97。

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数据为fastq文件，建议使用OBITOOLS等生物信息学工具进行读取并分析，具体可参考：https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.k6djh9w4r。

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数据的引用

刘兴起, 贾伟瀚. (2021). 青藏高原与西北干旱区33个湖泊表层沉积植物DNA数据. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.5061/dryad.k6djh9w4r.
[Liu, X., Jia, W. (2021). Data of plant DNA in surface sediments of 33 lakes in Qinghai-Tibetan Plateau and arid northwestern China. A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.5061/dryad.k6djh9w4r. ] (下载引用： RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

文章的引用

1. Stoof-Leichsenring KR, Liu S, Jia W, Li K, Pestryakova LA, Mischke S, Cao X, Liu X, Ni J, Neuhaus S, Herzschuh U (2020) Plant diversity in sedimentary DNA obtained from high-latitude (Siberia) and high-elevation lakes (China). Biodiversity Data Journal 8: e57089. https://doi.org/10.3897/BDJ.8.e57089( 查看 | Bibtex格式)

2. 贾伟瀚. (2020). 青藏高原与西北干旱区湖泊沉积物中植物DNA的现代过程研究. 北京: 首都师范大学.( 查看 | Bibtex格式)

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关键词

学科：陆地表层
主题：植被植物多样性
地点：青藏高原西北干旱区
时间：空

空间位置

East: 116.51	West: 81.24
South: 29.21	North: 47.10

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文件列表
时间分辨率：年
空间分辨率： -
大小： 3,173 MB
浏览： 1872 次
下载量： 100 次
共享方式：开放获取
数据时间描述：现代
元数据更新时间： 2022-04-19

联系信息

：刘兴起贾伟瀚

分发方：时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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