主要家养动物转录组测序数据(2020)

Transcriptome sequencing data of major domestic animals (2020)


为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们选取31个肯尼亚当地商品鸡和土鸡肾、脾、空肠RNA组织样品,提取总RNA后建库并做转录组测序。测序产生了一批180G转录组测序原始数据。为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集包含31个家鸡个体物种、品种、性别、表型等基本样品信息excel表,和31个家鸡个体3种组织转录组测序原始数据及MD5值。


数据文件命名方式和使用方法

转录组数据-个体编号,组织名称_RRA编号,使用cufflinks软件打开;样品信息-信息表,使用excel软件打开


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数据的引用

彭旻晟. (2020). 主要家养动物转录组测序数据(2020). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Ecolo.tpdc.271066. CSTR: 18406.11.Ecolo.tpdc.271066.
[Peng, M. (2020). Transcriptome sequencing data of major domestic animals (2020). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Ecolo.tpdc.271066. CSTR: 18406.11.Ecolo.tpdc.271066. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项(XDA20000000) (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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License: This work is licensed under an Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)


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East: 39.67 West: 36.82
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数据细节
  • 时间分辨率: 年
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  • 大小: 180,000 MB
  • 浏览: 2206 次
  • 下载量: 1 次
  • 共享方式: 保护期内
  • 数据时间范围: 2020-01-01 至 2020-12-31
  • 元数据更新时间: 2021-04-19

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联系信息
彭旻晟  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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