青藏高原湖水细菌多样性调查（V1.0）（2015）- 时空三极环境大数据平台

青藏高原湖水微生物多样性数据。样品采集时间为2015年7月1日至7月15日，包含28个湖泊(巴木措,白马湖,班戈盐湖,班公湖,崩错,别若则错,错萼措,错愕（平措北）,达瓦措,当穹错,当惹雍措,洞措,鄂雅错琼,公珠措,果根错,甲热布错,玛旁雍错,纳木错,聂尔错（盐湖）,诺尔玛措,朋彦错,蓬错,枪勇,色林错,吴如错,物玛错,扎日南木措,扎西措,)，138个样品。盐度梯度为0.07-118 ppm。

DNA提取方法：湖水过滤到0.45膜上，然后通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取DNA。16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')。测序方式为Illumina MiSeq PE250，原始数据通过Mothur软件分析，包括quality filtering, chimera removal, 序列分类依据Silva109数据库，古菌、真核和未知来源序列已被移除。OTU以97%相似度分类，然后只在数据库中出现一次的序列被移除。最后每个样品被重取样到7，230序列/样品。

GPS坐标,进化信息，环境因子见数据内。

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数据的引用

计慕侃. (2018). 青藏高原湖水细菌多样性调查（V1.0）（2015）. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Lake.tpe.0000009.file. CSTR: 18406.11.Lake.tpe.0000009.file.
[Ji, M. (2018). Bacteria distribution in Tibetan lakes (version 1.0) (2015). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Lake.tpe.0000009.file. CSTR: 18406.11.Lake.tpe.0000009.file. ] (下载引用： RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

地球大数据科学工程专项时空三极环境项目(XDA19000000) (项目编号:XDA19000000) CASEarth:Big Earth Data for Three Poles（grant No. XDA19070000）

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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数据时间范围： 2015-07-07 至 2015-07-21
元数据更新时间： 2021-04-19

联系信息

：计慕侃

分发方：时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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