主要家养动物基因组重测序数据(2020)

Genome re sequencing data of major domestic animals (2020)


为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们对201个全球家鸡血液、组织等DNA组织样品提取总DNA后建库并做全基因组测序,同时下载已公布家鸡基因组数据一共863个家鸡基因组开展群体分析,为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集相关文章已发表,本数据集内所有数据提供fastq,bam,vcf,snp文件在线下载。


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数据的引用

彭旻晟. (2020). 主要家养动物基因组重测序数据(2020). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.1038/s41422-020-0349-y.
[Peng, M. (2020). Genome re sequencing data of major domestic animals (2020). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.1038/s41422-020-0349-y. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

文章的引用

1. Wang, M.S., Thakur, M., Peng, M.S., Jiang, Y., Frantz, L.A.F., Li, M., Zhang, J.J., Wang, S., Peters, J., Otecko, N.O., Suwannapoom, C., Guo, X., Zheng, Z.Q., Esmailizadeh, A., Hirimuthugoda, N.Y., Ashari, H., Suladari, S., Zein, M.S.A., Kusza, S., Sohrabi, S., Kharrati-Koopaee, H., Shen, Q.K., Zeng, L., Yang, M.M., Wu, Y.J., Yang, X.Y., Lu, X.M., Jia, X.Z., Nie, Q.H., Lamont, S.J., Lasagna, E., Ceccobelli, S., Gunwardana, H., Senasige, T.M., Feng, S.H., Si, J.F., Zhang, H., Jin, J.Q., Li, M.L., Liu, Y.H., Chen, H.M., Ma, C., Dai, S.S., Bhuiyan, A., Khan, M.S., Silva, G., Le, T.T., Mwai, O.A., Ibrahim, M.N.M., Supple, M., Shapiro, B., Hanotte, O., Zhang, G., Larson, G., Han, J.L., Wu, D.D., Zhang, Y.P. (2020). 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Res. doi: 10.1038/s41422-020-0349-y.( 查看 | Bibtex格式)

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项(XDA20000000) (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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  • 数据时间范围: 2020-01-01 至 2020-12-31
  • 元数据更新时间: 2022-12-09
联系信息
彭旻晟  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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