沙冬青干旱胁迫响应的转录组学特征

Drought-response transcriptome of ammopiptanthus mongolicus


通过Hiseq2000对沙冬青叶片和根系进行高通量转录组测序,发现了44959个unigene。并通过数据库比对,对其中的43192个unigene进行功能注释。发现干旱处理下,在叶片和根中差异表达的基因(表达量上调或下调2倍以上)分别有1035个和1210个。这些差异表达的基因集中于与物质运输、胁迫响应以及代谢过程,分子结构活性等方面。鉴定出干旱胁迫下差异表达的(专一性)响应基因40个。通过对沙冬青转录因子的分析,还发现沙冬青包含50个转录因子家族,1575个转录因子。在叶片中7个转录因子表达量上升,50个下降;在根中有11上升,33个下降。


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苏彦华. (2016). 沙冬青干旱胁迫响应的转录组学特征. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.3972/heihe.096.2013.db. CSTR: 18406.11.heihe.096.2013.db.
[Su, Y. (2016). Drought-response transcriptome of ammopiptanthus mongolicus. A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.3972/heihe.096.2013.db. CSTR: 18406.11.heihe.096.2013.db. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

干旱环境下植物水分利用特征及其适应水分胁迫的分子机制研究(91125028) (项目编号:91125028)

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苏彦华  

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