青藏高原东南缘人群线粒体测序数据

Mitochondrial DNA genome sequencing dataset of populations from the southeastern Tibetan Plateau


采用sanger测序的方法,对青藏高原东南缘(云南西北部)258个样本进行线粒体DNA高变区测序。基于系统发育思想,我们对这些数据进行质量控制,确保没有样本污染等质量问题。以修订后的剑桥标准序列参考,进行突变位点的输出。根据世界范围内的人群的线粒体DNA系统发育树(PhyloTree.org),对每个样本进行单倍型类群划分。结合已发表的欧亚大陆其他人群的测序数据,系统研究青藏高原东南缘人群的母系遗传结构及其形成机制。结果表明,该地区人群中有着大量的古老世系,可能代表了早期迁徙到达东亚南部的人群遗传印记。此外,该地区人群中还包含有大量的东亚,尤其是东亚北部组分,可能与粟黍农业人群的迁徙和扩散有关。


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孔庆鹏. (2019). 青藏高原东南缘人群线粒体测序数据. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Ecolo.tpdc.270362. CSTR: 18406.11.Ecolo.tpdc.270362.
[Kong, Q. (2019). Mitochondrial DNA genome sequencing dataset of populations from the southeastern Tibetan Plateau. A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Ecolo.tpdc.270362. CSTR: 18406.11.Ecolo.tpdc.270362. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项(XDA20000000) (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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  • 数据时间范围: 2019-03-15 至 2019-05-24
  • 元数据更新时间: 2021-04-19
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孔庆鹏  

分发方: 时空三极环境大数据平台

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