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为研究蔓菁的扩散与人类活动之间的关系，我们将来自青藏高原及周边区域，以及巴基斯坦，印度，尼泊尔，德国，日本等地的蔓菁品种进行重测序，同时对基因家族进行聚类，以及特有、共有基因和基因家族统计，此外还将进行基因家族扩张收缩分析，系统发育树的构建，全基因组复制事件等分析。目的是解析人类活动和区域气候环境双重压力下，高原各地的传统蔓菁品种适应高原的分子基础。因此这项研究有助于揭示蔓菁适应高原生态环境的适应性机制以及在进化过程中人工驯化和人类选择对其遗传分化的影响。

数据文件命名方式和使用方法

文件命名：Brassicarapalinn_K778-S01-01-R01_good_2.fq.gz、Brassicarapalinn_K778-S01-01-R01_good_1.fq.gz。其中Brassicarapalinn_K778-S01-01代表物种类别及编号，R01代表样品编号，_1或_2代表数据的分段部分。
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段元文. (2020). 青藏高原植物基因组重测序数据（2019）. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Socioeco.tpdc.270394. CSTR: 18406.11.Socioeco.tpdc.270394.
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1. Yang, Y.Q., Sun, X.D., Kong, X.X., Wang, C.T., Yang, Y., Yin, X., Yang, D.N., Duan, Y.W., & Yang, Y.P. (2019). The Turnip Genome Provides Insights into Independent Evolution of Glucosinolate Biosynthesis, Nature Communications, 34(4), 848-854.( 查看 | Bibtex格式)

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项(XDA20000000) (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

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