典型年三极土壤微生物后处理产品(2005,2006,2015)

Post-processing products for typical year soil bacteria distribution in the Tripolar regions (2005, 2006, 2015)


典型年三极土壤微生物后处理产品收集了2005-2006年期间南北极地区土壤采样细菌分布分析结果和2015年期间青藏高原地区土壤采样细菌分布分析结果。通过整理归纳汇总得到三极区域土壤微生物后处理数据产品,数据格式为excel,方便用户查看。其中南北极地区样品采集时间为2005年12月13日至2006年12月8日,包含北极3个地区52个样品(Spitsbergen Slijeringa,Spitsbergen Vestpynten,及Alexandra Fjord Highlands),南极5个地区171个样品(Mitchell Peninsula,Casey station main power house, Robinsons Ridge,Herring Island,Browning Peninsula);青藏高原采集时间为2015年7月1日至7月15日,包含草甸,草原,荒漠3种生态系统,共计18个采样点位,每个采样点位样品个数为3-5个。采样点降水、气温和干旱度由气象信息估算得到,供读者参考。土壤表层样品采集后用液氮保存,运回悉尼实验室,通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用27F(5'-GAGTTTGATCNTGGCTCA-3')和 519R (5'-GTNTTACNGCGGCKGCTG-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过454方式测序,原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列,之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度,相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU,并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对,在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。


数据文件命名方式和使用方法

1. 投影:WGS84
2. 数据大小:2,504 KB
3. 数据格式:Excel数据库


本数据要求的引用方式 查看数据引用帮助 数据引用必读
数据的引用

叶爱中. (2022). 典型年三极土壤微生物后处理产品(2005,2006,2015). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Terre.tpdc.272726. CSTR: 18406.11.Terre.tpdc.272726.
[Ye, A. (2022). Post-processing products for typical year soil bacteria distribution in the Tripolar regions (2005, 2006, 2015). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Terre.tpdc.272726. CSTR: 18406.11.Terre.tpdc.272726. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

使用本数据时必须引用“文章的引用”中列出的文献,并进行数据的引用


参考文献

1.Ray, A. E., Zhang, E., Terauds, A., Ji, M., Kong, W., & Ferrari, B. C. (2020). Soil microbiomes with the genetic capacity for atmospheric chemosynthesis are widespread across the Poles and are associated with moisture, carbon, and nitrogen limitation. Frontiers in microbiology, 1936. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01936 (查看 )


资助项目

地球大数据科学工程专项时空三极环境项目(XDA19000000) (项目编号:XDA19000000) CASEarth:Big Earth Data for Three Poles(grant No. XDA19070000)

三极环境大数据分析方法库及其科学应用示范(XDA19070104) (项目编号:XDA19070104) [XDA19070104] the Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences

数据使用声明

为尊重知识产权、保障数据作者的权益、扩展数据中心的服务、评估数据的应用潜力,请数据使用者在使用数据所产生的研究成果中(包括公开发表的论文、论著、数据产品和未公开发表的研究报告、数据产品等成果),明确注明数据来源和数据作者。对于转载(二次或多次发布)的数据,作者还须注明原始数据来源。


License: This work is licensed under an Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)


相关资源

1. 2024-12-22 10*   用途:免登录下载 ……

2. 2024-12-21 10*   用途:免登录下载 ……

3. 2024-12-19 10*   用途:免登录下载 ……

4. 2024-12-15 10*   用途:免登录下载 ……

5. 2024-12-13 10*   用途:免登录下载 ……

6. 2024-12-12 10*   用途:免登录下载 ……

7. 2024-12-10 10*   用途:免登录下载 ……

8. 2024-12-06 10*   用途:免登录下载 ……

9. 2024-12-04 10*   用途:免登录下载 ……

10. 2024-12-02 10*   用途:免登录下载 ……

11. 2024-12-01 10*   用途:免登录下载 ……

12. 2024-11-30 10*   用途:免登录下载 ……

13. 2024-11-29 10*   用途:免登录下载 ……

14. 2024-11-26 10*   用途:免登录下载 ……

15. 2024-11-20 10*   用途:免登录下载 ……

16. 2024-11-17 10*   用途:免登录下载 ……

17. 2024-11-15 10*   用途:免登录下载 ……

18. 2024-11-13 10*   用途:免登录下载 ……

19. 2024-11-09 10*   用途:免登录下载 ……

20. 2024-11-08 10*   用途:免登录下载 ……

暂无数据

数据评论

当前页面默认显示 中文 评论 显示所有语种的评论

下 载 关注
关键词
空间位置
East: 0.50 West: 0.50
South: 90.00 North: 90.00
数据细节
  • 时间分辨率: 年
  • 空间分辨率: --
  • 大小: 2 MB
  • 浏览: 1676 次
  • 下载量: 245 次
  • 共享方式: 开放获取
  • 数据时间范围: 2005-12-31 至 2015-12-31
  • 元数据更新时间: 2022-09-02
联系信息
叶爱中  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

附件信息
导出元数据