大戟科和豆科基因组数据汇交(2015-2024)

Plateau plant genome data collection (2015-2024)


青藏高原丰富的生境多态性使其成为自然资源的宝库,高原植物中存在抗寒、耐旱、抗盐、抗紫外辐射、高光效等特殊的基因资源,如何挖掘利用并建立具有独立自主产权的功能基因资源,对我国现代农作物育种具有重要的潜在应用价值。高质量的染色体级基因组为解析植物适应性机制、抗逆性基因挖掘等相关研究提供了坚实的分子基础。本次数据汇交的内容主要为:大戟科青藏大戟的基因组数据集,包含染色体级基因组序列,注释文件;大戟科续随子的基因组数据集,包含染色体级基因组序列,注释文件;大戟科光棍树的基因组数据集,包含染色体级基因组序列,注释文件;豆科砂生槐的基因组数据集,包含染色体及基因组序列,注释文件。


数据文件命名方式和使用方法

基因组数据集文件包括两个:
1.基因组序列文件,文件名称为XXX.fa,其中XXX代表的是物种拉丁名的名称,打开方式:该文件为序列文本文件,使用文本打开软件即可(例如:Editplus)
2.基因组注释文件,文件名称为XXX.gff,其中XXX代表的是物种拉丁名的名称,打开方式:使用文本打开软件即可(例如:Editplus)


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数据的引用

杨永平. (2022). 大戟科和豆科基因组数据汇交(2015-2024). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Terre.tpdc.272670. CSTR: 18406.11.Terre.tpdc.272670.
[Yang, Y. (2022). Plateau plant genome data collection (2015-2024). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Terre.tpdc.272670. CSTR: 18406.11.Terre.tpdc.272670. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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数据细节
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  • 大小: 4,475 MB
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  • 共享方式: 申请获取
  • 数据时间范围: 2020-06-30 至 2022-07-01
  • 元数据更新时间: 2022-06-27
联系信息
杨永平  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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