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青藏高原及其周边高山地区孕育了高度的植物多样性，其成分来源复杂，既是现代高山植物的分布中心，也与其它地区的植物有着千丝万缕的联系。生长在这一地区的植物具有适应高原环境的独特基因资源，但受限于技术的发展，对这一地区植物的基因资源挖掘和利用仍然处于起步阶段。通过对龙胆科植物卵萼花锚和大花花锚开展比较基因组学研究，可解析植物交配系统进化的基因组效应，发掘与自交相关的关键基因，探讨植物混合交配系统的维持机制。本次数据汇交的内容主要为：卵萼花锚和大花花锚的基因组原始数据，包含卵萼花锚和大花花锚的三代Pacbio测序数据以及卵萼花锚和大花花锚的二代illumina测序数据。

数据文件命名方式和使用方法

每个物种的基因组数据集文件包括三个：
1.三代Pacbio基因组过滤序列文件，文件名称为XXX.genome.pass.fastq.gz，其中XXX代表的是物种拉丁名的简称（卵萼花锚为HE，大花花锚为HG），使用方式：该文件为序列文件，因文件较大，可使用linux系统的基础命令如less进行查看
2.二代基因组过滤序列文件，文件名称为XXX.R1.fastq.gz和XXX.R2.fastq.gz，其中XXX代表的是物种拉丁名的简称（卵萼花锚为HE，大花花锚为HG），R1和R2分别代表二代测序的正向测序和反向测序，使用方式：该文件为序列文件，因文件较大，可使用linux系统的基础命令如less进行查看

本数据要求的引用方式 查看数据引用帮助 数据引用必读

段元文. (2022). 卵萼花锚和大花花锚的基因组原始数据集汇交. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Terre.tpdc.272678. CSTR: 18406.11.Terre.tpdc.272678.
[Duan, Y. (2022). Original genome data sets of Halenia elliptica and Halenia grandiflora. A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Terre.tpdc.272678. CSTR: 18406.11.Terre.tpdc.272678. ] (下载引用： RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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License： This work is licensed under an Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)

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