本数据包括青藏高原纳木错地区土壤细菌分布数据，可用来探索围栏和放牧对纳木错地区土壤微生物的季节性影响，样品采集时间为2015年5月至9月，土壤样品用冰袋保存，运回北京青藏高原研究所生态实验室；本数据为扩增子测序结果，使用MoBio Powersoil™DNA分离试剂盒提取土壤DNA，引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3')和806R (5'GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3')，扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序。原始数据通过Qiime软件进行分析，之后计算序列之间相似度，并在相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU。采用Greengenes参考文库进行序列比对，去除了只在数据库中出现一次的序列。土壤含水率和土壤温度由土壤温湿度计测得，土壤pH值用pH计测定(Sartorius PB-10, Germany)，用2 M KCl(土壤/溶液，1:5)提取土壤硝态氮(NO3−)和铵态氮(NH4+)浓度，并用Smartchem200离散自动分析仪进行分析。本数据集对研究干旱半干旱草原土壤微生物多样性具有重大意义。
孔维栋
青藏高原草地土壤细菌多样性数据。样品采集时间为2017年7月至8月，包含高寒草甸，典型草原，荒漠草原3种生态系统共计120个样品。土壤表层样品采集后用冰袋保存，运回北京青藏高原研究所生态实验室，通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取土壤DNA，16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 806R (5´GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3´)，扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序。原始数据通过Qiime软件分析，序列分类依据Silva128数据库，将相似度在97%以上的序列聚类为一个操作分类单元（OTU）。本数据系统地比较了青藏高原样带草地土壤微生物的细菌多样性，对研究微生物在青藏高原的分布具有重大意义。
孔维栋
《2015年第三极部分湖泊水体细菌后处理产品和常规水质参数》数据集收集了2015年期间青藏高原地区部分湖泊水体采样细菌分析结果和常规水质参数。通过整理归纳汇总得到2015年第三极部分湖泊水体细菌后处理产品，数据格式为excel，方便用户查看。样品由计慕侃老师采集于2015年7月1日至7月15日，包含28个湖泊（巴木错，白马纳木错，班戈错（盐湖）， 班公错，崩错，别若则错，错鄂（申扎），错鄂（那曲），达瓦错，当穹错，当惹雍错，洞错，鄂雅错，公珠错，果根错，甲热布错，玛旁雍错，纳木错，聂尔错（盐湖），诺尔玛错，朋彦错（盐湖），蓬错，枪勇错，色林错，吴如错，物玛错，扎日南木错，扎西错），共计138个样品。其中湖泊水体细菌DNA提取方法如下：湖水过滤到0.45膜上，然后通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取DNA。16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')。测序方式为Illumina MiSeq PE250，原始数据通过Mothur软件分析，包括quality filtering, chimera removal,序列分类依据Silva109数据库，古菌、真核和未知来源序列已被移除。OTU以97%相似度分类，然后移除仅在数据库中出现一次的序列。常规水质检测参数包括：溶解氧、电导率、溶解性总固体、盐度、氧化还原电位、不挥发有机碳、总氮等。其中，溶解氧采用电极极谱法；电导率采用电导率仪；盐度采用盐度计；溶解性总固体采用TDS测试仪；氧化还原电位采用ORP在线分析仪；不挥发有机碳采用TOC分析仪；总氮采用分光光度法分别得到水质参数结果供参考。
叶爱中
第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题三“高原微生物多样性保护和可持续利用”（2019QZKK0503）第一、二年度共计开展30余次野外科学考察，足迹覆盖了青藏高原大部分地区，包括对藏东南、羌塘高原、可可西里、喜马拉雅区等区域冰川（如枪勇冰川、唐古拉冰川、珠峰东绒布冰川、杰马央宗冰川、帕隆4号冰川等）、湖泊（昂仁金错、错果、托素湖等）、河流（雅鲁藏布江等）、溪流、土壤、真菌地衣、动物多圈层微生物的考察。该数据集包含本专题第一、二年度野外考察收集的生境照、工作照、科考影像等电子数据，共计6,471个照片视频（其中照片6,124张）。
刘勇勤
该数据集包含2016年11月至2020年8月在青藏高原采集的15条冰川共269个冰雪样品微生物扩增子测序数据，包括24K冰川（24K）、冬克玛底冰川（DKMD）、敦德冰川（DD）、杰玛央宗冰川（JMYZ）、廓琼岗日冰川（KQGR）、来古冰川（LG）、帕隆4号冰川（PL4）、羌塘1号冰川（QT）、枪勇冰川（QY）、曲玛冰川（QM）、唐古拉龙匣宰陇巴冰川（TGL）、夏岗江冰川（XGJ）、雅拉冰川（YA）、泽普沟冰川（ZPG）、珠峰东绒布冰川（ZF）。采样区域经纬度范围为28.020°N到38.100°N和86.28°E到95.651°E。 通过聚合酶链式反应（PCR），采用515F/907R（或515F/806R）引物对16s rRNA基因的V4-V5区（或V4区）片段进行扩增，并用Illumina Hiseq2500测序平台测序获得原始数据。所选引物序列分别为：“515F_GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; 907R_CCGTCAATTCMTTTRAGTTT”“515F_GTGCCAGCMGCCGCGG, 806R_GGACTACHVGGGTWTCTAAT”。上传的数据包括：样品编号，样品描述，采样时间，经纬度坐标，样品类型，测序目标，测序片段，测序引物，测序平台，数据格式等基础信息，测序数据以序列文件数据格式正向 *.1.fq.gz和反向 *.2.fq.gz压缩文件储存。
刘勇勤
通过2019和2020年度的科考工作，第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题3课题4地衣科考分队（2019QZKK05030400）对青藏高原地区大量的地衣采集空白区域进行了补充采集。2019年度科考首次深入对藏北阿里地区进行地衣生物多样性深度考察，2020年度对可可西里，三江源等地衣考察空白地区进行野外考察和标本采集。这些考察工作揭开了青藏高原地区地衣组成的神秘面纱，填补了国内对该地区馆藏的空白。 本数据集包含自2019年7月至2020年9月在西藏自治区、青海省、四川省、云南省采集的10,283号地衣标本信息，其中包括采集生境、采集时间、采集人、经纬度、海拔、拉丁学名等信息。包含标本照片4,328张，其中2019年815号地衣标本的2,425张照片，2020年543号标本的1,903张照片。实体标本储存于中国科学院昆明植物研究所标本馆（KUN）。标本采集信息和野外生态照片等均在Biotracks数据库和KUN标本数据库等各个数据库之间实现了同步，便于相关人员后期研究、整理和查询。标本目前在KUN标本馆内按时间、地区、属名排序并单独存放，便于后续研究，并且都保存了相应的分子材料或获得了分子序列，为后续标本的分类和系统学研究奠定了良好的材料基础。目前也正在开展各类群的DNA提取和系统分类学研究工作。
王欣宇
为研究青藏高原及周边地区主要马属驯化动物的群体演化历史和局部适应遗传机制，并建立相应的种质遗传资源库。我们对在青海省、西藏自治区、新疆自治区采集的青藏高原及周边地区的马属样本进行测序：包括藏家驴、平原家驴等品种。测序包括denove和重测序数据，为追溯该地区主要马属驯化动物的驯化、迁徙、扩张等群体历史事件，并进一步探讨马属动物对缺氧、高寒、干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。同时，对家驴各组织进行测序，测序包括HIFI基因组数据、HiC基因组数据，为组装完整的驴的基因组做准备，便于后续分析。
李艳
生物多样性（biodiversity）是生物及其环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态过程的总和，表现在生命系统的各个组织水平上，包括遗传多样性、物种多样性以及生态系统多样性三个层次。生境质量越高，生物栖息地环境越好，生物多样性越高，在部分研究中采用生境质量指数来表征生物多样性（肖强 et al. 2014）。生境质量指数（Habitat Quality，HQ）是对区域土地利用类型的生境适宜性和生境退化程度状况进行评价的一个无量纲综合性指标，以耕地、道路、城镇和河流作为生境胁迫因子，打分形成敏感性参数。针对生物多样性产品生产，基于土地利用数据和InVEST模型进行了国家屏障区生态系统生物多样性建模研究。InVEST模型具有输入数据量少、导出数据量大、对抽象生态系统服务功能进行定量分析等优点，是当前生物多样性评估的重要手段。基于青藏高原地区土地利用的实际情况，选取水田、旱地、城镇用地、农村居民点和其他建设用地这5种人类活动影响极大的土地利用类型作为威胁因子。将土地利用数据作为InVEST模型的输入变量，基于参数化模型实现对青藏高原2000-2020年1km分辨率的陆地生物多样性估算。
王晓峰
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源，进行同质园实验获得表型数据，利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析，结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析，对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源，进行同质园实验获得表型数据，利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析，结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析，对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源，进行同质园实验获得表型数据，利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析，结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析，对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
裸大麦，西藏称青稞，它是西藏高原的主要农作物，藏族人民的主要食粮。其种植历史悠久，播种面积最大，分布范围最广，种植上限最高。就全自治区而言，常年的播种面积和总产量都占作物总播种面积和粮食总产量的一半以上。在海拔4200米以下的河谷地区，占当地作物播种面积的30—50%。在海拔4200—4500米的高寒农区，占当地作物播种面积的70—90%。在海拔4500米以上的农业点，裸大麦几乎是唯一的农作物。西藏裸大麦具有较强的耐寒、耐旱性，适应高原气候条件，自海拔1000多米至4500米左右广大的农区、农牧交错区都有分布，目前种植的上限达到4750米，是西藏作物分布的最高上限。1974年青藏高原综合科学考察队从四川进藏，沿途进行了线路考察。在昌都地区察雅县吉塘区调查野生大麦时，藏族社员提供了半野生小麦的情况，它是一种在形态上很象小麦，而在成熟时穗轴断裂的一种小麦，一般是做为田间杂草混杂在青稞与小麦田间。采集了植株标本和种子。当考察队到达西藏自治区农科所时，得知自治区农科所程天庆、董玉鳌同志1962年曾在山南地区隆子县三安曲林采集到一种成熟时穗轴折断的小麦，它和我们在西藏其它地区采集到的材料同属于一个类型。随后，在日喀则地区农科所，谭昌华同志讲他在仁布县也看到过这种在成熟时穗轴折断的小麦。除了上述地区，这一年的考察中，还在山南加查县、贡嘎县、隆子县附近发现了这种野生小麦。目前已知的分布地区包括了澜沧江流域，雅鲁藏布江流域和隆子河流域。
路季梅
西藏的农业集中分布在藏南雅鲁藏布江流域和藏东怒江、澜沧江、金沙江流域的河谷地带。河谷农区的耕地面积占全自治区耕地总面积的75%，粮食产量占全自治区粮食总产量的80%以上。小麦、裸大麦（西藏称青稞）是西藏自治区主要的粮食作物，常年播种面积占粮食总播面积的80%以上，而河谷农区的小麦、裸大麦，又占全自治区小麦、裸大麦播种面积的75%和总产的82%。河谷农区处于北纬28-31°之间，海拔在2700—4100米范围内，属于高原温带气候，土壤、水利条件较好，作物产量较高。但是解放前在黑暗的封建农奴制度下，人民生活极端贫困，农业生产十分落后，粮食亩产仅百余斤。解放后，特别是1972年以来，在河谷农区大面积推广冬小麦，促进了耕作制度的变革，粮食产量显著上升。1975年全区粮食总产比1965年增长50%以上，比民主改革前的1958年增长1.5倍以上。1977年全区冬麦播种面积近70万亩，约占粮食播种面积的20%。冬小麦种植范围已由原来的海拔3000米以下地区，扩展到海拔4100米以下的广大地区，西藏高原已由历史上的春麦区，发展成为春麦、冬麦兼种区。1977年河谷农区冬小麦的平均亩产超过了400斤，裸大麦、春小麦的平均亩产亦达300斤，各地还出现了一批小麦、棵大麦亩产千斤以上的高产田块，最高亩产量达到1673斤。
路季梅
一定的水热状况和土壤条件是作物生长的基础，西藏高原地域广大，不同地区的海拔高度与地表形态的变化极为复杂，高原气候与土壤产生明显的空间变化，因而耕地与作物分布具有很大的地区性。西藏境内有着东西向和南北向的两组高大山脉，构成高原的基本骨架。高山之间分布着辽阔的高原，并有许多低山、丘陵、湖盆与河谷镶嵌其间，全区总的地势自东南向西北逐渐拾升，东南部的海拔较低，西部、北部的海拔较高。雄伟的喜马拉雅山矗立在南部和西部的中印、中尼、中锡、中不、中巴边界上，全长2400公里，山体宽200-300公里，平均海拔在6000米以上，构成了青藏高原南部的天然屏障。孟加拉湾的暖湿气流受山体阻隔，喜马拉雅山南坡的气侯温暖湿润，喜马拉雅山北麓的气候温凉干燥，南坡、北麓形成两个不同的气侯区域。喜马拉雅山南侧山地河流深切，为高山峡谷地貌。谷地海拔多在3000米以下，气候暖热、湿润。土壤类型丰富，主要有山地黄壤、山地棕壤、山地褐土和高山草甸土等，土壤呈酸性至中性反应，含有较丰富的腐殖质，含氮量较高，质地较粗，通透性好。地表径流丰富，水利灌溉条件较优。但由于地形限制，土地大多因坡度大于25度而不能利用，多为森林所覆盖。耕地主要分布在海拔4000米以下的沿河谷地上，面积很有限。
路季梅
第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题一“高原动物多样性保护和可持续利用”（2019QZKK0501）第二年度（2020年底至2021年）采集的动物标本、组织样本、DNA条码样品等实体样品信息。所有数据按课题、子课题整理，文件夹按课题号、子课题号命名。每个文件夹包含1个数据集规范表，1个或多个标本信息表，1个或多个组织样品信息表。每个信息表包含子课题编号、物种、采集地、采集时间、采集人、样品类型、保存方式等信息。
青藏高原动物资源共享平台
1）数据内容：面对未来气候变化青藏高原10种两栖类爬行类遗传多样性的变化。2）数据来源及加工方法：基于青藏高原10种两栖爬行类条形码数据，结合SDM、MPTP approach等软件构建未来2050年、2070年、2090年等时期的遗传多样性及分布情况。3）数据质量描述：数据质量经过核查，分析数据人员经过实验室严格培训。4）数据应用成果及前景：发现分布于青藏高原北部的两栖爬行类需要在保护上给与更多的关注。
沈文菁
利用野外调查和文献调研收集到的青海沙蜥（Phrynocephalus vlangalii）分布点，结合五个来自于WorldClim数据库的气候因子，分别将当前（1960-1990年）和未来（2061-2080年）的气候数据输入训练好的物种分布模型，对当前和未来的适宜栖息地进行预测。预测结果表明，在青海沙蜥在气候变化下将会丧失大量原有栖息地，针对青海沙蜥的保护措施应重点关注青藏高原东缘，柴达木盆地北部和东部这些地区。模型也预测在气候变化后，新的适宜栖息地将在原本不适宜青海沙蜥生存的地区出现。然而，由于爬行动物的扩散能力非常有限（文献记录的最大年扩散距离不足500m），新出现的适宜栖息地不一定能被青海沙蜥利用。同时，通过野外工作收集三个海拔种群青海沙蜥的生理、生活史、行为及形态数据并结合微气候数据，利用机制生态位模型预测了气候变化在当前适宜分布区对青海沙蜥造成的生理后果。模型预测的结果表明，无论在SSP245还是SSP585气候变化情景下，青海沙蜥的活动时间在当前适宜分布区的大部分范围（> 93%）内都会增加，热安全阈在当前适宜分布区的所有地点都会减少。高海拔种群的活动时间增幅小于低海拔种群，而其热安全阈减少的幅度却大于低海拔种群。研究结果揭示了气候变化可能对分布在高海拔地区的蜥蜴种群造成更大影响。
曾治高
1) 数据内容：2021年青藏高原为中心的泛第三极钩虾物种多样性比较分析结果；2) 数据来源及加工方法：基于青藏高原及其周边地区567条遗传数据运用BEAST软件构建系统发育树；基于青藏高原3180条分布数据，包括经纬度、海拔，运用ArcView、Maxent软件构建LGM、Mid-Holocene、现在、和未来时期的预测分布图；3) 数据质量描述：样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对，确保分布数据的质量，分析人员均进过实验室的严格培训；4) 数据应用成果及前景：发现以青藏高原为核心的泛第三极包括丰富的钩虾物种多样性，但大多数物种还没有正式描记和发表，有待下一步工作的开展。该研究为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
为掌握高原农牧象虫以及相关鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫物种组成、区系特点及寄主信息，建立高原农牧天敌昆虫的DNA条形码快速鉴定体系，评估天敌资源现状，提出天敌昆虫可持续利用建议。子课题2019QZKK05010606在青藏高原开展重点农牧区、大宗作物相关象虫以及鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫资源调查，天敌昆虫物种多样性数据库建设，天敌资源现状评估和可持续利用评估。2020年期间西藏自治区、云南省农牧交错区、农林交错区，农区与牧区腹地，开展农牧鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫关键类群调查，进行标本采集、样品采集，生物学信息与生态环境信息收集等，按照标准和规范系统整理天敌昆虫标本，并有效保藏，开展物种形态鉴定并获取DNA条形码信息，整合物种地理分布、寄主信息、生态图片等信息，构建天敌物种多样性信息库；对天敌资源现状进行评估并提出可持续利用的建议。
刘宁
为掌握高原农牧象虫以及相关鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫物种组成、区系特点及寄主信息，建立高原农牧天敌昆虫的DNA条形码快速鉴定体系，评估天敌资源现状，提出天敌昆虫可持续利用建议。子课题2019QZKK05010601在青藏高原开展重点农牧区、大宗作物相关象虫以及鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫资源调查，天敌昆虫物种多样性数据库建设，天敌资源现状评估和可持续利用评估。2020年期间西藏自治区、云南省农牧交错区、农林交错区，农区与牧区腹地，开展农牧鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫关键类群调查，进行标本采集、样品采集，生物学信息与生态环境信息收集等，按照标准和规范系统整理天敌昆虫标本，并有效保藏，开展物种形态鉴定并获取DNA条形码信息，整合物种地理分布、寄主信息、生态图片等信息，构建天敌物种多样性信息库；对天敌资源现状进行评估并提出可持续利用的建议。
乔格侠
为描述青藏高原重要啮齿动物遗传多样性分布格局，厘清其相关遗传背景，分析其在全球气候变化的大背景下种群波动规律及其影响因素，分析高原鼠兔对鸟类的影响和在维持生态系统稳定性中的意义，为探讨高原物种的适应与进化机制、构建种群暴发预测预警体系，正确认识高原鼠兔在生态系统中的地位和作用，提出及时有效的种群管理对策具有重要的理论和实践意义。子课题（2019QZKK05010410）2021年集中在青海海西蒙古藏族自治州、果洛州、海南州调查高原鼠兔，共采集200份高原鼠兔脾、肺等组织样品。本数据集包含1个样品信息表，照片。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。
曲家鹏
高原鼢鼠和高原鼠兔是广泛分布于青藏高原及周边平原地区的特有种和关键物种，不同的地理位置和生态环境造成了多样化的物种形成。这些物种的起源和演化的研究还有待完善。同时，它们的地理分布和形态特征是很好的研究高原适应和适应性进化的材料，比较高原与其他低海拔平原近缘种的基因组、转录组和表观遗传组学的分析，能够帮助解析高原适应的机制，初步探索表观修饰在高原适应中发挥作用的机制。2021年集中在青海省共采集16个动物的组织样本共计112份。本数据集包含一个样品信息表，样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。为探讨高原旗舰物种的高原适应性进化问题，对青海玛多县和拉脊山地区16个高原鼢鼠、鼠兔个体开展ChIP-seq测序转录组测序，每个个体产生15Gb数据，共600Gb。数据以fastq格式存储。
吕雪梅
为评估家栖鼠类对青藏高原生物多样性和人们生产生活的危害，评估后续潜在生态影响和风险，为制定更加科学有效的生物防控和生态保护措施提供全新的依据。子课题（2019QZKK05010303）2021年在西藏拉萨、青海海西州、四川成都调查高原境内家栖鼠类物种组成、种群特征、分布范围进行全面的实地调查，并采集家栖鼠类样品。共采集80份大家鼠、小家鼠组织样品。本数据集包含1个组织样品信息表，记录采集地、采集时间、物种、样品类型等信息。
靖美东
为分析西藏地区不同种群的沙蜥对环境变化的表型与遗传适应，本子课题（2019QZKK05010216）选择依据高原内海拔梯度垂直带为主线，在红尾沙蜥分布区全境采集标本，比较该种不同种群的形态、生理和生活史的差异，分析其对环境变化的表型与遗传适应，结合物种分布模型和机制模型预测红尾沙蜥未来的受胁程度，提出气候变暖背景下高原沙蜥的保护对策，为环境变化背景下的青藏高原爬行动物多样性保护提供理论依据。于2021年在甘肃省酒泉、青海省德令哈等地区采集沙蜥样品资源。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。照片，以jpg格式存储。
计翔
为探讨青藏高原与横断山地区两栖爬行类物种多样性、遗传多样性与分布格局，厘清其分类与进化地位，以及相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2021年整理出2020-2021年采集的两栖爬行动物标本50份、组织样本100份。本数据集包含1个样品信息表、1个标本信息表和300张照片。样品信息表包含物种、详细采样地、经纬度、海拔、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。照片，以jpg格式存储。
李家堂
冬虫夏草（Ophiocordyceps sinensis）是一种经济价值极高的药用真菌，国家二级野生保护植物，主要分布于青藏高原以及周边高海拔地区的高寒草甸生境中，在该物种的传统产区，虫草收入是农牧民重要的经济收入来源，同时该物种是也青藏高原高寒草地生态系统的重要组成部分。 本数据根据已发表的野外调查和实验数据，以冬虫夏草干燥品腺苷含量为其质量标准，建立了一个综合生态位模型来模拟基准气候条件以及未来4种气候变化情景下4个时间段的冬虫夏草潜在分布区变化以及高质量虫草的空间分布格局变化。
郭彦龙
本数据包含了2019年度，在色林错和纳木错周遭地区，共21个湖泊的底栖动物数据，采样主要在沿岸带使用底拖网和深水区使用Ekman采集器，将两种途径获取的材料整合之后，给出了各个湖泊底栖动物数据相对丰度，主要湖泊底栖种类分别为湖沼钩虾、水龟虫和摇蚊幼虫，但是螺类以及介形类出现频率较低，可能与采样点设置有关。该数据进一步将不同类型的底栖划分为21个分类单元，提高了识别精度和认知范围，将为高原湖泊水生动物多样性和渔业资源评估提供参考。
唐红渠
植被净初级生产力（Net Primary Production，NPP）是维系人类及异养有机体生命的基础资源，是衡量生态系统结构特征与承载能力的基础指标。本数据采用基于植被光合呼吸模型（Vegetation Photosynthesis Model，VPM）研制的2015年植被总初级生产力（Gross Primary Production，GPP）数据，通过自养呼吸比率计算得到NPP数据。数据可用于分析青藏高原的植被生产力的空间分异格局，对青藏高原的生态保护研究具有重要意义。
闫慧敏
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库，本科考队于2018至2019年集中在云南大理、云南香格里拉、西藏芒康、甘肃碌曲、西藏察隅、西藏阿里那曲昌都、新疆和田、新疆伊犁地区采集当地家养动物血液或组织样品，同时拍摄样品对应个体照片。每个文件夹包含1套当地家养动物照片和1个样品信息表。照片以jpg格式存储。信息表记录物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息，以excel表形式存储。
尹婷婷, 彭旻晟
高原鼢鼠（Eospalax baileyi）是鼹形鼠科、鼢鼠属的动物，长期生活于地下黑暗封闭洞穴中，不冬眠，主要采食植物的地下根系，1年繁殖1次，每胎产仔数1-6只，主要栖息于高寒草甸、草甸化草原、草原化草甸、高寒灌丛、高原农田、荒坡等比较湿润的河岸阶地、山间盆地、滩地和山麓缓坡，仅分布在中国西部和西北部，海拔2800-4500米。分布在高海拔地区的高原鼢鼠不仅面临着地下洞穴的低氧胁迫，还面临着高原低氧的双重压力。长期的低氧生活除了在基因组序列上积累适应性突变，也会在基因组的结构和基因表达调控上体现适应性调控改变，通过分析不同海拔的高原鼢鼠的DNA甲基化和转录组数据，可以尝试解析高原鼢鼠在表观调控和基因表达水平的适应性进化和调控机制。
吕雪梅
班戈、伦坡拉地点的化石研究意义重大，化石的年代数据不可或缺。该地区发育有火山凝灰岩，其中的锆石可用来做U-Pb年龄分析，以此来判断地层及化石的年龄。本数据以图示的方式展示班戈、伦坡拉化石地点凝灰岩样品中的锆石U-Pb年龄分析结果，图中标明了大量锆石的外形，并在不同的锆石样品上标明了年龄分析结果，数据展示了相关研究所采用的较大的样本量，分析结果也较清晰。本数据的图片展示直观清楚，结果可靠，对青藏高原的研究有着较为重大的意义。
孙博阳
2018年产生的蔓菁基因组序列，经过Hi-C测序后的生物信息学分析可以实现将初步组装的基因组草图中的大部分序列定位到染色体，并能够确定这些序列在染色体上的顺序和方向，为获得高质量的序列图谱奠定重要的基础。故课题组通过该技术把蔓菁基因组序列草图中的序列分别划分到同该物种染色体数目一致的群组（Group）中，并且确定每一群组中所有序列的顺序（Order）及方向（Orientation），之后可以结合参考蔓菁基因组、转录组组装序列（EST序列）、近缘物种及遗传图谱数据对划分群组的准确性及序列之间的顺序和方向进行评估。
段元文
1）数据内容：青藏高原气候变化背景下钩虾预测图；2）数据来源及加工方法：基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库：包括经纬度、海拔，运用ArcView、Maxent软件制作青藏高原钩虾现在、Mid-Holocene和LGM时期预测图；3）数据质量描述：样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对，确保分布数据的质量，分析人员均经过实验室的严格培训；4）数据应用成果及前景：综合分析西藏地区钩虾分布数据、物种多样性和遗传多样性，从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应，为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
数据内容：包含青藏高原湖泊采集点，钩虾遗传多样性图，项目对青藏高原及其周边地区620个溪流湖泊开展钩虾样品采集并开展了遗传多样性研究，以期为青藏高原湖泊水资源和生物多样性保护提供基础资料。 数据来源及加工方法：本数据集为第一手数据，自主产生。本数据集中标本采集点为项目组2017至2020年在青藏高原开展了4次采集考察所获得。分子数据是对采集标本提取COI序列，作为分子证据，开展遗传多样性分析；主要仪器为PCR仪，型号为Mastercycler X50s，厂家为eppendorf。 数据质量描述：数据集基本覆盖了青藏高原，并增加青藏高原周边地区的样品。 数据应用成果及前景：为生物多样性保护提供基础数据。
侯仲娥
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物疾病情况，调查青藏高原主要家养动物的疫病情况，对各主要家养动物的主要流行疾病进行抗病和易感个体的遗传样本及肠道微生物样品的采集工作。我们在青海省海西蒙古族藏族自治州乌兰县漠河骆驼场采集骆驼粪便。本数据集是青海省骆驼的肠道微生物16srRNA测序数据。通过提取骆驼粪便的微生物总DNA，设计引物扩增细菌的V3-V4区基因片段，再进行二代高通量测序得到相应数据。本数据集共测序44份样品。本数据集可应用于挖掘抗病个体基因层面的遗传资源，找到相应的候选基因。
段子渊
数据集包含1980，1990，2000，2010，2017年青藏高原草地产草量空间分布。基于中国科学院地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力模型VIP（Vegetation Interface Process) 模拟了青藏高原草地总初级生产力（GPP），利用经验系数估算了净初级生产力（NPP），将NPP换算为干物质，再根据根冠比估算了干草产量。空间分辨率1公里。该数据集将为草地资源管理、开发、利用以及“以草定畜”策略的制定提供依据。
莫兴国
数据集包含2000年，2010年，2018年青藏高原县级理论载畜量数据和1980年, 1990年, 2000年, 2010年, 2017年县级超载程度。基于地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力学模型VIP（Vegetation interface process) 模拟的NPP数据计算了产草量数据（1km分辨率），按照县行政区域尺度，计算县域产草量，并根据载畜量计算标准（NY/T 635-2015）计算得到县域范围内的理论载畜量。基于县级实际载畜量数据，计算了超载程度。数据将为草地恢复、管理和利用策略的制定提供借鉴。
莫兴国
根据已获得的基因组数据进行筛选从而得到的候选基因，大部分与生理发育相关，为研究候选基因的具体调节机制，因此进行对应的功能验证试验。因此通过获得相应的转基因小鼠，并对其纯合型和野生型样本的相应组织进行转录组测序（共计22份组织样本，包括大脑、骨髓、肌肉组织）。之后通过对此批转录组数据进行分析，从而完善对候选基因的功能验证，为了解物种在不同地区适应性遗传机制，以及生长发育过程中的生理调节提供有力的资料。
李艳
为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原，探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系，2018年6月，课题组利用三代基因组测序技术，对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装，得到组装基因组大小为409.69 Mb，Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时，这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响，以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。
段元文
数据包括青藏高原地区县域尺度的特色农业分布县数据，为青藏高原特色农业空间布局及发展奠定基础。数据来源于西藏高原特色农产品基地发展规划（2015-2020年）等青藏高原地区各省份的规划文件。数据为县级尺度的特色农业分布，包含的种类有青稞、牦牛、绵羊和枸杞四种农产品，实现了县域尺度特色农业主要农产品的空间化，时间范围设定为2015-2020年，参照数据来源中的各省份的特色农业规划建设时间。数据可以应用于特色农业空间布局现状及未来地区特色农业发展的研究。
史文娇
人类活动造成的全球气候变化是生物多样性的主要威胁之一，预测气候变化对物种分布的可能影响，对生物多样性保护具有重要的意义。我们通过长期野外考察和文献收集，获得了12个青藏高原独有的广布两栖爬行动物的分布数据。为保证数据质量，所有物种文献记录的分布点均有DNA测序数据。之后我们使用最大熵值法（Maxent）构建了物种分布模型，评估模型后预测了未来不同时期的物种潜在分布范围。这一结果为青藏高原生物多样性保护，青藏高原物种遗传多样性保护提供了理论支撑。
车静
1）数据内容：青藏高原钩虾分布图；2）数据来源及加工方法：基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库：包括经纬度、海拔，运用ArcView软件制作青藏高原钩虾分布图；3）数据质量描述：样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对，确保分布数据的质量，分析人员均经过实验室的严格培训；4）数据应用成果及前景：综合分析西藏地区钩虾分布数据、物种多样性和遗传多样性，从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应，为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据；5）图例信息：褐色圆圈代表天山分布点；粉色圆圈代表青藏高原面上雅鲁藏布江以北分布点，其分化时间约为2-4个百万年；绿色三角代表雅鲁藏布江以南分布点，其分化时间约为4-6个百万年；黄色圆圈代表喜马拉雅分布点，其分化时间约为3个百万年；橙色正方形代表横断山分布点，其分化时间约为5-7个百万年；蓝色圆点为青藏高原东部分布点。
侯仲娥
结合对青藏高原的野外实地调查，并参考已有文献资料，本数据集归纳了分布于我国青藏高原及周边地区包括西藏、云南、四川、贵州四地的蝮亚科蝮蛇物种名录，以及它们的地理分布。青藏高原及周边地区共有蝮蛇24种，隶属于8属，分布的物种数占中国的蝮蛇物种数67%，有7种为该区域内的特有物种。在川、滇、黔、藏四个地区，以云南分布的蝮蛇物种数量最多，达13种；西藏和重庆分布的物种数量最少，仅有7种。数据集可以为青藏高原及周边区域生物多样性编目提供重要的资料。
郭鹏
1)数据内容：包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、分布地；2）数据来源及加工方法：基于2000至2019年间对青藏高原及泛第三极野外科考，记录该地区淡水甲壳动物钩虾的物种组成和分布范围；3）数据质量描述：样品的采集和检测人员均经过实验室的严格培训。样品采集过程中，低温保存，并在规定的时间内送达实验室。样品在实验室分析过程中，采用重复测定，确保检测数据的质量。4）数据应用成果及前景：以青藏高原湖泊中的优势类群钩虾为研究对象，围绕气候环境变化对生物多样性的影响以及生物对环境变化的响应这一主题，获取青藏高原及泛第三极湖泊水系中钩虾的物种数量、分布、以及遗传数据。
侯仲娥
本数据集是1990年至2015年青藏高原地区生态要素数据集，记录了青海西藏两省15个地级单元湿地、草地、林地、沙地四种类型用地每五年的面积占比变化情况。数据为excel文件，空间分辨率为地级行政单元尺度。该数据是根据青藏高原土地利用类型数据，通过计算每个地级单元面积内的湿地、草地、林地和沙地的面积占地级单元面积比例得到，数据集可用于青藏高原生态要素的变化分析研究，可以为城镇化与生态环境交互胁迫研究提供数据支撑。
杜云艳, 易嘉伟
本技术框架旨在探索气候变化对外温动物的物种适合度的影响。通过查阅文献和实验研究获取动物的形态、生理、行为和生活史参数；然后利用微气候模型和全球升温数据，获取当前和本世纪末的微气候数据；再利用生物物理模型计算成体体温和胚胎发育温度，构建生活史机制模型，计算全年繁殖母体的能量收支及存活后代的总能量，评估各区域外温动物的受胁程度。本研究的重点在于构建两种繁殖模式物种的分段生活史机制模型，从而能动态地计算各个生活史的开始时间和持续时间，并结合能量代谢和胚胎发育的模型计算各个生活史阶段的能量动态。
曾治高
基于西藏地区的钩虾物种名录及其分布基础数据库，采用分子生物学方法构建西藏地区钩虾谱系关系图。提取钩虾新鲜标本的基因组DNA，通过PCR扩增获取分子序列，应用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树。每个种群选取10个个体进行简化基因组测序，构建基因组，分析种群动态。综合分析西藏地区钩虾谱系关系图，从进化、遗传的视角探讨气候环境变化对钩虾多样性的影响以及钩虾对环境变化的响应，为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
本技术框架旨在评估不同类型环境因素对物种分布的影响，进而改善模型预测能力，更准确地评估未来物种分布区域的变化。通过设定不同类型环境因子的组合，预测末次冰期物种分布范围。再与现在分布范围进行比较，得到不同的假定物种群体动态模型。通过遗传数据，重建物种群体进化历史，并与基于物种分布模型获得的假定群体进化历史进行比较，确定预测能力最好的环境因子组合。再利用该环境因子组合，预测未来气候变化背景下物种分布区域的可能变化。本技术框架利用物种群体历史，对气候模型进行检验，可以有效改进物种分布模型的预测能力。
车静
该数据集是中国科学院西北高原生物研究所在三江源国家公园野生动物多样性本底调查过程获得的野生动物分布位点信息。该数据集时间范围是2017年，调查范围是三江源国家公园，调查物种包括藏野驴（Equus kiang）、狼(Canis lupus)、赤狐(Vulpes vulpes)、马鹿(Cervus elaphus)、雀鹰(Accipiter nisus)、红腹红尾鸲(Phoenicurus erythrogastrus)、豹猫(Prionailurus bengalensis)、大鵟(Buteo hemilasius)、藏原羚(Procapra picticaudata)、藏雪鸡(Tetraogallus tibetanus)、高原山鹑(Perdix hodgsoniae)、猎隼(Falco cherrug)等多种珍稀野生动物。
张同作
本数据集包括近三年青藏高原古脊椎动物研究的几项重大成果。王晓鸣等（2016）报道了一新属新种，喜马拉雅原羊，这一新类群的发现表明青藏高原，可能还包括天山-阿尔泰山脉代表着山地盘羊类最早的起源地，而且以这些原始的盘羊类有可能就是现生盘羊的最近祖先。李强等（2017）报道了两种新的仓鼠类：邱氏微仓鼠和刘氏高冠仓鼠，这两个新种的发现表明仓鼠类在上新世时期向青藏高原的高海拔地区扩散，与大哺乳动物走出西藏的说法恰好相反。吴飞翔等（2017）报道了新属新种西藏始攀鲈，攀鲈类在这一地区的发现表明，藏北地区在晚渐新世的海拔为1000米左右，这一与近年来一些指出西藏是高海拔干旱地区的主流观点相反。数据为以上研究材料的图片。这些成果为青藏高原的研究打开了一些新的道路。
吴飞翔
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中国科学院西北生态环境资源研究院
0931-4967287
poles@itpcas.ac.cn
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