基于2000至2018年间对青藏高原及泛第三极野外科考基础上，记录该地区淡水甲壳动物钩虾的物种组成和分布范围。以青藏高原湖泊中的优势类群钩虾为研究对象，围绕气候环境变化对生物多样性的影响以及生物对环境变化的响应这一主题，获取青藏高原及泛第三极湖泊水系中钩虾的物种数量、分布相关数据。根据《中国动物志甲壳动物亚门端足目钩虾亚目(三）》鉴定物种，根据海拔、经纬度等信息分析物种多样性及分布格局，为评估生物多样性格局及制定保护策略提供理论依据。
侯仲娥
基于2008年至2018年在青藏高原进行的野外科考基础上，通过文献证据整理进行补充，我们获得了所有青藏高原两栖爬行类广布种群体水平的遗传数据。以这些广布物种为研究对象，围绕环境指示动物类群对气候环境变化的响应过程这一主题，我们首先分析了第四纪气候变化对物种遗传结构的影响，重建了第四纪冰期以来物种群体变化趋势，并确定了各个物种的冰期避难点。同时，构建了青藏高原两栖爬行类遗传多样性地理分布格局，确定了遗传多样性热点。这一结果对整个青藏高原生物多样性保护具有重要的意义。
车静
为研究青藏高原及周边地区主要马属驯化动物的群体演化历史和局部适应遗传机制，并建立相应的种质遗传资源库。我们对截止2018年底在青海省、西藏自治区、新疆自治区采集的青藏高原及周边地区的236份马属样本进行全基因组重测序：包括藏马、藏家驴、平原家驴、家马平原地方品种。并对75份样本（包括73份驴的样本和两份马的样本）进行线粒体基因组测序以及D-loop测序。测序产生了一批基因组学数据，为追溯该地区主要马属驯化动物的驯化、迁徙、扩张等群体历史事件，并进一步探讨马属动物对缺氧、高寒、干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。
李艳
2018年的采集地点位于在新疆维吾尔自治区喀什地区的塔什库尔干县。塔什库尔干县是中国境内帕米尔高原所在地，这里平均海拔高于4000米，县城所在地是全县最低的位置海拔也有3100米。本次采集工作主要采集了帕米尔高原塔什库尔干保护区内家养动物黄牛、牦牛、绵羊、山羊、驴、马和家鸡共计204份，每份样品包括3-4个重复。其中每份样品有对应的样品采集信息：动物种类、性别、样品采集时间、样品采集点经纬度、海拔和采集地名称。采集的每一只/头动物均有对应的特征照片，包括头部、蹄/爪和全身。
徐峰, 汪沐阳
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局，厘清其相关遗传背景，并建立相应的遗传资源库。2018年我们在云南省、四川省、西藏自治区共采集343份青藏高原及周边地区包含牦牛、藏猪、藏獒、绵羊、藏鸡等在内的主要驯化动物样品。并对云南西北和邻近西藏东南地区收集到的159份家鸡样本进行线粒体DNA测序；对收集到的11份野猪、藏猪、其他家猪样本进行了全基因组重测序；对前期收集到的193份家牛样本进行GBS测序。测序产生了一批遗传学和基因组学数据为追溯该地区主要驯化动物的驯化、迁徙、扩张等群体历史事件，并进一步探讨驯化动物对缺氧、高寒、干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。
尹婷婷, 彭旻晟
基于《中国动物志》、《西藏两栖爬行动物志》、2000-2018年间发表的中英文文献，以及2018-2019年对青藏高原地区的野外科考，记录该地区蜥蜴亚目的物种组成和分布范围。以在青藏高原各海拔梯度广泛分布的陆生脊椎动物类群蜥蜴为研究对象，围绕气候变化对生物多样性的影响以及外温动物对环境变化的响应，获取青藏高原及泛第三极地区蜥蜴的物种数量、分布相关数据。根据《中国动物志有鳞目蜥蜴亚目》鉴定物种，根据海拔、经纬度等信息分析物种多样性及分布格局，为评估生物多样性格局及制定保护策略提供理论依据。
曾治高
通过对青藏高原151、江西沟1、江西沟2、黑马河1、下大武遗址、耶则热、尼阿底和伶坰等8个旧石器时代遗址进行考古调查和发掘，获取了各遗址经纬度、高程、文化属性、文化遗物等基本信息；同时，对遗址发掘过程中的动植物遗存进行科学收集、鉴定和实验室分析，得到了一批遗址碳十四年代数据、动物遗存鉴定数据、植物大遗存鉴定数据、木炭鉴定数据和碳氮稳定同位素数据。该数据集为研究青藏高原旧石器时代先民的活动历史和生业模式提供了数据支撑。
张东菊, 张晓凌, 刘向军
对以西藏、青海为主的青藏高原覆盖地区的家养动物（牦牛、藏羊、骆驼、马等共405份粪便样品）进行隐孢子虫（Cryptosporidium spp.）和微孢子虫（E. bieneusi）进行了巢式PCR检测。1、 隐孢子虫的总体感染率为2.96%（12/405），在青海地区的骆驼、藏羊和牦牛中的检出率分为15%、9.8%及3.1%。在云南地区的牦牛中检测率为3.1%。而西藏和云南地区的其他家养动物中未检出。青海骆驼中检出两种隐孢子虫亚种，其中C.bovis亚型为首次在骆驼中检出；在云南牦牛中首次检出C.ryanae亚型。 微孢子虫（E. bieneusi）在青藏高原地区家养动物中的总体检出率为19.75%（80/405），共检出9种已知亚型和一种新亚型（YN）。其中检出率最高的为青海地区骆驼（45%），其次为蒙古羊（42.1%）、牦牛（37.5%）、马（15.62%）、藏羊（7.3%）。而西藏地区藏羊的检出率为10.8%。云南地区中山羊和黄牛中的检出率分别为36%和25.7%。在青海马中首次检测出CAM2亚型，牦牛中首次检测到CAM1亚型；云南黄牛中检测一种新亚型YN。
张志超, 段子渊
通过对青藏高原梅诺、萨日果、容哇果、卡则、吉哈、牙日给、巴米、巴荣巴当、青土、拉布、麦松岩画、尕拉、耶则热地点1和耶则热地点4等14个历史时期遗址进行考古调查和试掘，获取了各遗址经纬度、高程、文化属性、文化遗物等基本信息；同时，对遗址调查和发掘过程中的动植物遗存进行科学收集、鉴定和实验室分析，得到了一批遗址的碳十四年代数据和动物遗存鉴定数据。该数据集为研究青藏高原历史时期先民的活动历史和生业模式提供了数据支撑。
董广辉, 侯光良
基于2007至2018年间对青藏高原和干旱荒漠区野外科考基础上，通过与国内外同行合作，进一步加强信息采集，记录青藏高原与邻近阿拉善荒漠沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种组成和分布范围。以亚洲内陆干旱区环境指示生物爬行类的代表属：沙蜥属和麻蜥属为研究对象，围绕气候环境变化对生物多样性的影响以及生物对环境变以化的响应这一主题，获取青藏高原与邻近阿拉善荒漠沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种数量、分布相关数据。根据经纬度可以分析物种多样性及分布格局，为评估生物多样性格局及制定保护策略提供理论依据。
郭宪光
品种资源是畜禽产业发展的基础，遗传资源库是培育和改良品种的根本。青海和甘肃省地处青藏高原及其周边地区，独特的自然环境和长期的人工选育，培育了许多具有地方特色、适应当地生长的优良地方品种和生态型。然而，由于集约化养殖和外来商业品种的引入，对地方家养动物的土著品种造成了冲击，两省的畜禽遗传资源发生了动态的变化，家养动物的多样性正在退化，遗传资源保护面临巨大的挑战。本研究以家养动物的形态特征和生产性能指标为着眼点，通过广泛采样调查，对两省家养动物的体型特征、品种资源的种类进行评估和厘定，确定保护品种和核心保护区，为地方优良种质资源的提纯复壮奠定基础，并为高原特色畜产品的保护和可追溯体系提供技术支撑，有效促进高原畜牧业的发展。
田菲
通过对青藏高原高苜蓿地、朵家梁、水口、棋盘山、新寨、参雄尕塑、鸟岛、邦嘎和白羊村等25个新石器-青铜时代遗址进行考古调查和发掘，获取了各遗址经纬度、高程、文化属性、文化遗物等基本信息；同时，对遗址调查和发掘过程中的动植物遗存进行科学收集、鉴定和实验室分析，得到了一批遗址碳十四年代数据、动物遗存鉴定数据、植物大遗存鉴定数据和碳氮稳定同位素数据。该数据集为研究青藏高原新石器-青铜时代先民的活动历史和生业模式提供了数据支撑。
董广辉, 杨晓燕, 吕红亮
采用高通量二代测序的方法，对671个藏族样本进行线粒体全基因组测序。测序平均深度1000×，确保每个样本的线粒体基因组完全覆盖（覆盖度100%）。基于系统发育思想，我们对这些数据进行质量控制，确保没有样本污染等质量问题。结合已发表的欧亚大陆其他人群的测序数据，系统研究藏族人群的母系遗传结构及其形成机制。结果表明，藏族人群中有20.98%可追溯至5.2-4.0 ka，与粟黍农业扩散至青藏高原的时间吻合。进一步分析表明，这些组分很可能于10-7 ka前起源于中国北方，与粟黍农业的起源和强化一致。因此，这些组分很可能代表了伴随粟黍农业传播进入青藏高原的粟黍农业人群。通过估算，这些组分在5.2-4.0 ka占藏族人群的40-50%。说明粟黍农业人群得迁徙极大地促进了对藏族人群的遗传结构形成。
孔庆鹏
青藏高原冰川细菌资源库数据集提供了刘勇勤实验组在2010-2018年间分离的青藏高原7条冰川（珠峰东绒布冰川，天山一号冰川，古里雅冰川，老虎沟冰川，木孜塔格冰川，七一冰川和玉珠峰冰川），向述荣分离的马兰冰川和张新芳分离的普若岗日冰川的细菌16S核糖体RNA基因序列。冰川样品采集后带回北京青藏高原院研究所生态实验室和兰州冰冻圈国家实验室，涂布平板后于不同温度下（4-25摄氏度）培养20天-90天并挑取单菌落纯化。分离的细菌提取DNA后以27F/1492R引物扩增16S核糖体RNA基因片段，并使用Sanger法测序。16S核糖体RNA基因序列通过“Classifier”软件与RDP数据库进行比对，在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。 本数据包含每条序列的16S核糖体RNA基因片段序列及冰川来源。与以高通量测序为基础的序列相比，本数据的序列长度更长，分类更准确，更好的服务于冰川微生物研究。
计慕侃
南北极及青藏高原冰川雪和冰里原核微生物分布数据集提供了刘勇勤实验组在2010-2018年间从NCBI数据库收集的细菌16S核糖体RNA基因序列。 NCBI数据库搜索的关键词为Antarctic, Arctic Tibetan, Glacier.。收集的序列通过使用DOTOUR软件计算序列之间相似度，相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU，并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过“Classifier”软件与RDP数据库进行比对，在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。获得序列后，通过阅读序列文件中样品信息获得样品的GPS坐标。本数据包含每条序列的16S核糖体RNA基因片段序列，进化分类，及样品GPS坐标。本数据与以高通量测序为基础的序列相比，本数据的序列长度更长，分类更准确，对于比较三极微生物的进化信息，以及研究嗜冷微生物进化的认识有重要意义。
计慕侃
青藏高原土壤细菌多样性数据集提供了青藏高原土壤表层（0-2厘米）微生物分布特征。样品采集时间为2015年7月1日至7月15日，包含草甸，草原，荒漠3种生态系统。土壤样品用冰袋保存，运回北京青藏高原研究所生态实验室。土壤DNA通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取。土壤表层样品采集后用液氮保存，运回悉尼实验室，通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序，原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列，之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度，相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU，并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对，在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。本数据系统的比较了青藏高原微生物的多样性，对研究微生物在青藏高原的分布具有重大意义。
计慕侃
青藏高原湖水微生物多样性数据。样品采集时间为2015年7月1日至7月15日，包含28个湖泊(巴木措,白马湖,班戈盐湖,班公湖,崩错,别若则错,错萼措,错愕（平措北）,达瓦措,当穹错,当惹雍措,洞措,鄂雅错琼,公珠措,果根错,甲热布错,玛旁雍错,纳木错,聂尔错（盐湖）,诺尔玛措,朋彦错,蓬错,枪勇,色林错,吴如错,物玛错,扎日南木措,扎西措,)，138个样品。盐度梯度为0.07-118 ppm。 DNA提取方法：湖水过滤到0.45膜上，然后通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取DNA。16S rRNA基因片段扩增引物为515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')。测序方式为Illumina MiSeq PE250，原始数据通过Mothur软件分析，包括quality filtering, chimera removal, 序列分类依据Silva109数据库，古菌、真核和未知来源序列已被移除。OTU以97%相似度分类，然后只在数据库中出现一次的序列被移除。最后每个样品被重取样到7，230序列/样品。 GPS坐标,进化信息，环境因子见数据内。
计慕侃
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0931-4967287
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