采用红外相机调查法获取地栖大中型野生动物的出现数据。2021年布设红外相机262台,获得野生动物照片12391张,记录到大中型哺乳动物41种。小型兽类数据包含物种、多度、体重等性状数据、环境梯度数据等,可为理解环境梯度-物种多度-物种性状间的关联及垂直梯度哺乳动物群落构建的生态过程提供数据支撑。红外相机数据主要收集珍稀濒危野生动物的出现数据,可补充区域生物多样性本底,同时为生物多样性热点区及保护关键区识别提供科学依据。
李学友
第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题三“高原微生物多样性保护和可持续利用”(2019QZKK0503)第一、二年度共计开展30余次野外科学考察,足迹覆盖了青藏高原大部分地区,包括对藏东南、羌塘高原、可可西里、喜马拉雅区等区域冰川(如枪勇冰川、唐古拉冰川、珠峰东绒布冰川、杰马央宗冰川、帕隆4号冰川等)、湖泊(昂仁金错、错果、托素湖等)、河流(雅鲁藏布江等)、溪流、土壤、真菌地衣、动物多圈层微生物的考察。该数据集包含本专题第一、二年度野外考察收集的生境照、工作照、科考影像等电子数据,共计6,471个照片视频(其中照片6,124张)。
刘勇勤
2021年仍采用样点法对岗日嘎布山沿海拔梯度的鸟类进行调查,按400米海拔跨度对考察区域分别设置海拔带,北坡从波密县通麦镇至嘎隆寺,由低到高设置了5个海拔带,南坡从墨脱县背崩乡解放大桥至嘎隆拉,由低到高设置了8个海拔带,获取岗日嘎布西北段南北坡鸟类多样性和分布数据,以期对理解这一区域鸟类多样性的形成和维持机制方面取得重大突破,进一步探讨气候变化对鸟类多样性的影响与适应策略、物种多样性对全球变化的响应与保护策略等关键科学问题。
王洁
该数据集包含2016年11月至2020年8月在青藏高原采集的15条冰川共269个冰雪样品微生物扩增子测序数据,包括24K冰川(24K)、冬克玛底冰川(DKMD)、敦德冰川(DD)、杰玛央宗冰川(JMYZ)、廓琼岗日冰川(KQGR)、来古冰川(LG)、帕隆4号冰川(PL4)、羌塘1号冰川(QT)、枪勇冰川(QY)、曲玛冰川(QM)、唐古拉龙匣宰陇巴冰川(TGL)、夏岗江冰川(XGJ)、雅拉冰川(YA)、泽普沟冰川(ZPG)、珠峰东绒布冰川(ZF)。采样区域经纬度范围为28.020°N到38.100°N和86.28°E到95.651°E。 通过聚合酶链式反应(PCR),采用515F/907R(或515F/806R)引物对16s rRNA基因的V4-V5区(或V4区)片段进行扩增,并用Illumina Hiseq2500测序平台测序获得原始数据。所选引物序列分别为:“515F_GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; 907R_CCGTCAATTCMTTTRAGTTT”“515F_GTGCCAGCMGCCGCGG, 806R_GGACTACHVGGGTWTCTAAT”。上传的数据包括:样品编号,样品描述,采样时间,经纬度坐标,样品类型,测序目标,测序片段,测序引物,测序平台,数据格式等基础信息,测序数据以序列文件数据格式正向 *.1.fq.gz和反向 *.2.fq.gz压缩文件储存。
刘勇勤
为描述青藏高原重要啮齿动物遗传多样性分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年本子课题(2019QZKK05010410)集中在青海海西蒙古藏族自治州、果洛州、海南州开展高原鼠兔调查,共采集200份高原鼠兔样品,实体样品为脾、肺组织。本数据集包含1个样品信息表和生境照、工作照、工作视频。样品信息表包含物种、性别、详细采样地、海拔、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
曲家鹏
为描述青藏高原高原鼠兔种质资源遗传多样性分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年子课题(2019QZKK05010209)集中在青海省(海西蒙古族藏族自治州,格尔木市,昆仑山口;海西蒙古族藏族自治州,都兰县,香日德镇,沟里乡;果洛藏族自治州,玛多县;果洛藏族自治州,玛沁县,大武镇;黄南藏族自治州,泽库县;海南藏族自治州,贵南县,塔秀乡)不同海拔区域采集93份高原鼠兔种质资源,实体样品包括血液或、组织、粪便等。本数据集包含1个样品信息表。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
张良志
为整合泛第三极家鸡数据,建设“全球家鸡基因组数据库(Chicken2K)”,为国际家鸡起源驯化选择研究提供基础数据,为家鸡新品种选育改良提供科学指导。2022年本子课题与中国西南野生生物种质资源库(动物种质资源库)合作,申请使用库内近年采集保藏的东南亚地区家养动物遗传样本,挑选代表性个体开展遗传多样性评估。本数据集包含动物种质资源库馆藏的东南亚国家(老挝、泰国、缅甸、越南)家鸡及红原鸡血液、组织样品信息共224份。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
彭旻晟
生物多样性(biodiversity)是生物及其环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态过程的总和,表现在生命系统的各个组织水平上,包括遗传多样性、物种多样性以及生态系统多样性三个层次。生境质量越高,生物栖息地环境越好,生物多样性越高,在部分研究中采用生境质量指数来表征生物多样性(肖强 et al. 2014)。生境质量指数(Habitat Quality,HQ)是对区域土地利用类型的生境适宜性和生境退化程度状况进行评价的一个无量纲综合性指标,以耕地、道路、城镇和河流作为生境胁迫因子,打分形成敏感性参数。针对生物多样性产品生产,基于土地利用数据和InVEST模型进行了国家屏障区生态系统生物多样性建模研究。InVEST模型具有输入数据量少、导出数据量大、对抽象生态系统服务功能进行定量分析等优点,是当前生物多样性评估的重要手段。基于青藏高原地区土地利用的实际情况,选取水田、旱地、城镇用地、农村居民点和其他建设用地这5种人类活动影响极大的土地利用类型作为威胁因子。将土地利用数据作为InVEST模型的输入变量,基于参数化模型实现对青藏高原2000-2020年1km分辨率的陆地生物多样性估算。
王晓峰
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源,进行同质园实验获得表型数据,利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析,结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析,对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源,进行同质园实验获得表型数据,利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析,结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析,对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
调查并收集青藏高原及周边地区的蔓菁种质资源,进行同质园实验获得表型数据,利用基因组测序技术获得数据文库并构建高质量参考基因组。使用重测序技术对蔓菁群体进行结构分析,结合早期人类迁徙及扩散路线对蔓菁在青藏高原现代地理分布格局形成的历史过程进行探究。与表型数据进行关联分析,对蔓菁现代居群适应性机制进行解析。从全基因组层面上理解泛第三极的环境差异以及不同地区人类活动和文化差异对青藏高原植物迁徙、适应及驯化的影响。
段元文
为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们对266个全球家鸡血液、组织等DNA组织样品提取总DNA后建库并做全基因组测序,同时下载已公布家鸡基因组数据一共863个家鸡基因组开展群体分析,为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集相关文章已发表,本数据集内所有数据提供fastq,bam,vcf,snp文件在线下载。
彭旻晟
裸大麦,西藏称青稞,它是西藏高原的主要农作物,藏族人民的主要食粮。其种植历史悠久,播种面积最大,分布范围最广,种植上限最高。就全自治区而言,常年的播种面积和总产量都占作物总播种面积和粮食总产量的一半以上。在海拔4200米以下的河谷地区,占当地作物播种面积的30—50%。在海拔4200—4500米的高寒农区,占当地作物播种面积的70—90%。在海拔4500米以上的农业点,裸大麦几乎是唯一的农作物。西藏裸大麦具有较强的耐寒、耐旱性,适应高原气候条件,自海拔1000多米至4500米左右广大的农区、农牧交错区都有分布,目前种植的上限达到4750米,是西藏作物分布的最高上限。1974年青藏高原综合科学考察队从四川进藏,沿途进行了线路考察。在昌都地区察雅县吉塘区调查野生大麦时,藏族社员提供了半野生小麦的情况,它是一种在形态上很象小麦,而在成熟时穗轴断裂的一种小麦,一般是做为田间杂草混杂在青稞与小麦田间。采集了植株标本和种子。当考察队到达西藏自治区农科所时,得知自治区农科所程天庆、董玉鳌同志1962年曾在山南地区隆子县三安曲林采集到一种成熟时穗轴折断的小麦,它和我们在西藏其它地区采集到的材料同属于一个类型。随后,在日喀则地区农科所,谭昌华同志讲他在仁布县也看到过这种在成熟时穗轴折断的小麦。除了上述地区,这一年的考察中,还在山南加查县、贡嘎县、隆子县附近发现了这种野生小麦。目前已知的分布地区包括了澜沧江流域,雅鲁藏布江流域和隆子河流域。
路季梅
西藏的农业集中分布在藏南雅鲁藏布江流域和藏东怒江、澜沧江、金沙江流域的河谷地带。河谷农区的耕地面积占全自治区耕地总面积的75%,粮食产量占全自治区粮食总产量的80%以上。小麦、裸大麦(西藏称青稞)是西藏自治区主要的粮食作物,常年播种面积占粮食总播面积的80%以上,而河谷农区的小麦、裸大麦,又占全自治区小麦、裸大麦播种面积的75%和总产的82%。河谷农区处于北纬28-31°之间,海拔在2700—4100米范围内,属于高原温带气候,土壤、水利条件较好,作物产量较高。但是解放前在黑暗的封建农奴制度下,人民生活极端贫困,农业生产十分落后,粮食亩产仅百余斤。解放后,特别是1972年以来,在河谷农区大面积推广冬小麦,促进了耕作制度的变革,粮食产量显著上升。1975年全区粮食总产比1965年增长50%以上,比民主改革前的1958年增长1.5倍以上。1977年全区冬麦播种面积近70万亩,约占粮食播种面积的20%。冬小麦种植范围已由原来的海拔3000米以下地区,扩展到海拔4100米以下的广大地区,西藏高原已由历史上的春麦区,发展成为春麦、冬麦兼种区。1977年河谷农区冬小麦的平均亩产超过了400斤,裸大麦、春小麦的平均亩产亦达300斤,各地还出现了一批小麦、棵大麦亩产千斤以上的高产田块,最高亩产量达到1673斤。
路季梅
一定的水热状况和土壤条件是作物生长的基础,西藏高原地域广大,不同地区的海拔高度与地表形态的变化极为复杂,高原气候与土壤产生明显的空间变化,因而耕地与作物分布具有很大的地区性。西藏境内有着东西向和南北向的两组高大山脉,构成高原的基本骨架。高山之间分布着辽阔的高原,并有许多低山、丘陵、湖盆与河谷镶嵌其间,全区总的地势自东南向西北逐渐拾升,东南部的海拔较低,西部、北部的海拔较高。雄伟的喜马拉雅山矗立在南部和西部的中印、中尼、中锡、中不、中巴边界上,全长2400公里,山体宽200-300公里,平均海拔在6000米以上,构成了青藏高原南部的天然屏障。孟加拉湾的暖湿气流受山体阻隔,喜马拉雅山南坡的气侯温暖湿润,喜马拉雅山北麓的气候温凉干燥,南坡、北麓形成两个不同的气侯区域。喜马拉雅山南侧山地河流深切,为高山峡谷地貌。谷地海拔多在3000米以下,气候暖热、湿润。土壤类型丰富,主要有山地黄壤、山地棕壤、山地褐土和高山草甸土等,土壤呈酸性至中性反应,含有较丰富的腐殖质,含氮量较高,质地较粗,通透性好。地表径流丰富,水利灌溉条件较优。但由于地形限制,土地大多因坡度大于25度而不能利用,多为森林所覆盖。耕地主要分布在海拔4000米以下的沿河谷地上,面积很有限。
路季梅
为系统调查西藏墨脱及周边地区昆虫物种,分析昆虫多样性分布格局,本子课题(2019QZKK05010101)在西藏墨脱及周边地区使用陷阱法、网扫法、灯诱法、马来氏网法等方法采集鞘翅目、膜翅目、鳞翅目、双翅目、半翅目等代表性昆虫类群,录入昆虫标本信息,拍摄昆虫图片和视频资料。本数据集包含自2019年7月至2020年9月在西藏墨脱县、波密县、察隅县、林芝市、米林县地区采集的11272份昆虫标本信息。其中包括采集地、采集时间、经纬度、海拔、分类学名称等信息,实体标本保存于国家动物博物馆。
梁红斌
平原人群入藏后往往出现高原反应。为深入解析高原反应及高原习服过程中的基因组表达谱变化模式。基于mRNA转录组测序方法,我们目前已获得46个个体入藏前(采集地:重庆)的转录组测序数据。 我们首先采集46名平原汉族个体的外周血样本,并用红细胞裂解液(Tiangen)处理外周血,4000 rpm离心10 min,分离提取白细胞,使用TRIzol法提取每个样本的总RNA,然后使用Poly(A)捕获法构建了46个文库。Poly(A)+ mRNA文库用oligo(dT)珠从每个样本的1 g总RNA中分离。RNA-seq文库的构建按照TruSeq RNA文库制备方案进行,并使用Novaseq平台对46个RNA文库进行双端测序,测序结果为150-bp reads的fastq文件,每个样本数据量均超过6.0 Gbp。 平原人群入藏前的转录组数据,可作为入藏后的基线数据。通过比较分析平原人群入藏前后的转录组数据,筛选入藏前后的显著差异表达基因,并注释差异表达基因调控的生物学功能,可深入解析高原反应及高原习服过程中的基因表达变化模式及功能调控网络机制。
孔庆鹏
第二次青藏高原综合科学考察研究任务五专题一“高原动物多样性保护和可持续利用”(2019QZKK0501)第二年度(2020年底至2021年)采集的动物标本、组织样本、DNA条码样品等实体样品信息。所有数据按课题、子课题整理,文件夹按课题号、子课题号命名。每个文件夹包含1个数据集规范表,1个或多个标本信息表,1个或多个组织样品信息表。每个信息表包含子课题编号、物种、采集地、采集时间、采集人、样品类型、保存方式等信息。
青藏高原动物资源共享平台
“西南高山峡谷哺乳动物物种与分布数据库”包含横断山区哺乳动物名录、物种保护信息和国内分布信息。名录包含科名、属名、物种名;保护信息包含国家重点保护野生动物等级(2021)、CITES附录(2019)、IUCN红色名录(2021)、中国物种红色名录(2021);分布信息包括是否为中国特有种和物种在国内分布的省区。数据来源于中国科学院昆明动物研究所馆藏标本、项目执行期采集的标本、拍摄的红外相机照片、文献等。数据质量可靠。该数据库可为西南高山峡谷地区哺乳动物的研究和保护提供基础数据支撑。
李权
本数据库为西南高山峡谷两栖爬行动物物种名录及其分布数据,包括本区域近300种两栖爬行动物的9544条分布记录。本数据库的物种分布信息主要获取自野外第一手数据及国内外著名动物网站,如物种2000。此数据主要涉及本地区两栖爬行动物的物种名、目科属名、省市县、小地名、经纬度、海拔等信息。此数据可用于探讨西南高山峡谷的两栖爬行动物区系、区划,亦为西南地区乃至东南亚地区的两栖爬行动物多样性、生态系统等研究奠定了坚实基础。
江建平
西南高山峡谷区是世界上生物多样性热点区域之一,建立生物-气候-地理数据库是研究该区域生物多样性的分布格局和形成原因的前提。在项目组提供的本区域7千余种植物分布信息的基础上,结合气候数据(来源于NCEP Reanalysis Products,https://psl.noaa.gov/data/gridded/data.ncep.reanalysis.surface.html, 1950-2020年平均值),建立西南高山峡谷区生物多样性生态环境综合数据库。生物数据包括动植物科属种名称、采集地经纬度信息等,地理数据包含海拔和坡度,气候数据包括降雨量和气温在内的24个指标。本数据库对研究该区域生物多样性分布规律、现状、形成机制和保育网络规划等提供支撑。
何洪鸣, 赵宏飞, 黄先寒
对雅鲁藏布江中、上游干流及年楚河、多雄藏布、来乌藏布等支流区域展开调查,涉及西藏日喀则市南木林、江孜、亚东、吉隆、萨嘎、仲巴等县。在以往人类活动的空白区如错戳龙湖、多庆湖、仲珠谷、罗垄沟等多个地点发现新的人类活动遗迹点,在30余处地点采集到人类活动的重要石器证据,材质包括黑曜石、碧玉岩、水晶等。后续将通过类型学对这些石器的工艺和来源进行进一步分析,为揭示雅鲁藏布江中上游区域史前人类活动历史的时空变化及与周边文化技术交流情况具有重要意义。
杨晓燕, 高玉
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。我们于2021年在云南省采集了大额牛(独龙牛)血液、心脏、肝脏、脾脏、肺、肾、肌肉、脂肪、大肠、小肠、胃、睾丸组织17个个体共267份酒精、RNAlater保存或液氮冻存样品。本数据集包含样品物种、品种、详细采样地、性别、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以及个体照片。实体样品保存于中国西南野生生物种质资源库动物种质资源库。
李艳
1)数据内容:面对未来气候变化青藏高原10种两栖类爬行类遗传多样性的变化。2)数据来源及加工方法:基于青藏高原10种两栖爬行类条形码数据,结合SDM、MPTP approach等软件构建未来2050年、2070年、2090年等时期的遗传多样性及分布情况。3)数据质量描述:数据质量经过核查,分析数据人员经过实验室严格培训。4)数据应用成果及前景:发现分布于青藏高原北部的两栖爬行类需要在保护上给与更多的关注。
沈文菁
利用野外调查和文献调研收集到的青海沙蜥(Phrynocephalus vlangalii)分布点,结合五个来自于WorldClim数据库的气候因子,分别将当前(1960-1990年)和未来(2061-2080年)的气候数据输入训练好的物种分布模型,对当前和未来的适宜栖息地进行预测。预测结果表明,在青海沙蜥在气候变化下将会丧失大量原有栖息地,针对青海沙蜥的保护措施应重点关注青藏高原东缘,柴达木盆地北部和东部这些地区。模型也预测在气候变化后,新的适宜栖息地将在原本不适宜青海沙蜥生存的地区出现。然而,由于爬行动物的扩散能力非常有限(文献记录的最大年扩散距离不足500m),新出现的适宜栖息地不一定能被青海沙蜥利用。同时,通过野外工作收集三个海拔种群青海沙蜥的生理、生活史、行为及形态数据并结合微气候数据,利用机制生态位模型预测了气候变化在当前适宜分布区对青海沙蜥造成的生理后果。模型预测的结果表明,无论在SSP245还是SSP585气候变化情景下,青海沙蜥的活动时间在当前适宜分布区的大部分范围(> 93%)内都会增加,热安全阈在当前适宜分布区的所有地点都会减少。高海拔种群的活动时间增幅小于低海拔种群,而其热安全阈减少的幅度却大于低海拔种群。研究结果揭示了气候变化可能对分布在高海拔地区的蜥蜴种群造成更大影响。
曾治高
1)数据内容:柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属物种名录及其分布数据,包含纲、目、科中文名、科拉丁名、属中文名、属拉丁名、种拉丁名、种中文名、国家、省、市县、镇乡等分布地;2)数据来源及加工方法:基于2007至2021年间对柴达木盆地干旱荒漠区两栖爬行动物野外科考,记录该地区沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种组成和分布范围;3)数据质量描述:标本的调查、采集和鉴定人员均为专业人员,样品的采集信息经过核对,确保分布数据的质量;4)数据应用成果及前景:综合分析柴达木盆地沙蜥属和麻蜥属蜥蜴的物种多样性和分布数据,可以为西北荒漠区及亚洲中部干旱区生物多样性编目提供重要资料,为评估生物多样性格局及制定保护策略提供科学依据。
郭宪光
1) 数据内容:2021年青藏高原为中心的泛第三极钩虾物种多样性比较分析结果;2) 数据来源及加工方法:基于青藏高原及其周边地区567条遗传数据运用BEAST软件构建系统发育树;基于青藏高原3180条分布数据,包括经纬度、海拔,运用ArcView、Maxent软件构建LGM、Mid-Holocene、现在、和未来时期的预测分布图;3) 数据质量描述:样品的采集和经纬度、海拔信息经过核对,确保分布数据的质量,分析人员均进过实验室的严格培训;4) 数据应用成果及前景:发现以青藏高原为核心的泛第三极包括丰富的钩虾物种多样性,但大多数物种还没有正式描记和发表,有待下一步工作的开展。该研究为西藏地区生物多样性评估和生态保护提供科学依据。
侯仲娥
兴都库什山脉(Hindu kush Mountains)是亚洲中部的高大山脉。平均海拔约5000米,最高峰蒂里奇米尔峰海拔7690米,是发源于青藏高原西南部的印度河和发源于帕米尔高原的阿姆河的分水岭。研究该区域人群的遗传结构,有助于深入理解该地区人群的扩散历史和适应高原环境的遗传基础。在本研究中,我们对分布于兴都库什山脉的5个群体的213个个体进行了母系遗传结构的研究。采用线粒体基因组捕获建库和二代测序(Illumina HiSeq X Ten platform)的方法,获得了213个个体的线粒体全基因组序列(平均深度>1000x)。基于系统发育思想,我们对这些数据进行质量控制,确保没有样本污染等质量问题。以修订后的剑桥标准序列参考,进行突变位点的输出。根据世界范围内的人群的线粒体DNA系统发育树(PhyloTree.org),对每个样本进行单倍型类群划分。综合以往发表的现代人群和古代样本的mtDNA数据,系统研究了该地区人群的起源和扩散历史。结果表明,该地区的印欧语系人群的主要母系遗传组分来源于欧亚西部。单倍群W3a1a和J1b1a1等类群可能与印欧语系人群的迁徙有关,说明印欧语系向南亚的扩散可能不仅仅是简单的文化扩张,也伴随着一部分的人群迁徙。此外,研究还表明,巴基斯坦北部可能在印欧语系向南亚的扩散中起着重要的通道作用。
孔庆鹏
本数据集包含三台部署在东北虎豹国家公园的陆生脊椎动物红外相机及环境参量观测数据集。本设备部署在东北虎豹国家公园的两个地点,时间跨度(2020.8-2021.6)。由于设备维护,光照不足等,部分数据不连续,但三台设备的数据可互为补充,可重建出2020.8-2021.6虎豹国家公园内观测点的全部信息。 三台设备中,有两台设备配备了红外相机,分别采集到216张照片及1239张照片,可与上述传感器照片相互匹配后,获得拍照前后的生态因子信息。 1. 虎豹国家公园林区出没的野生动物以及温度、湿度、光照、压强以及网络信号强度信息。采集间隔每半小时一次; 2. 数据来源:"陆生脊椎动物监测设备研制“课题,2016YFC0500104,完成单位:中国科学院动物研究所,原始数据,未加工; 3. 传感器数据采集间隔每半小时一次,温度精度正负0.1度,湿度精度正负0.5%,照片数据分为触发和定时两种,触发数据一般由出没在红外相机视野内的野生动物触发;定时拍照数据根据电池电量情况动态调节,采集间隔在1-12小时之间; 4. 本数据可用于记录保护区内的环境温度,结合红外相机数据,可用于分析野生动物活动节律,共存分析以及分布的限制因子等。
乔慧捷
本数据集包含两台部署在祁连山保护区的陆生脊椎动物红外相机及环境参量数据集。本设备部署在祁连山保护区寺大隆附近,时间跨度(2020.8-2021.10)。由于设备维护,光照不足等,部分数据不连续,但两台设备的数据可互为补充,可以重建出2020.8-2021.10祁连山保护区内观测点的全部信息。 两台设备有一台设备配备了红外相机,采集到4994张照片,可与上述传感器照片相互匹配后,或者拍照前后的生态因子信息。由于单个压缩文件较大,故采用分卷压缩,需要将三个压缩文件都下载后方可解压缩。 1. 祁连山保护区内出没的野生动物以及温度、湿度、光照、压强以及网络信号强度信息。采集间隔每半小时一次; 2. 数据来源:"陆生脊椎动物监测设备研制“课题,2016YFC0500104,完成单位:中国科学院动物研究所,原始数据,未加工; 3. 传感器数据采集间隔每半小时一次,温度精度正负0.1度,湿度精度正负0.5%,照片数据分为触发和定时两种,触发数据一般由出没在红外相机视野内的野生动物触发;定时拍照数据根据电池电量情况动态调节,采集间隔在1-12小时之间; 4. 本数据可用于记录保护区内的环境温度,结合红外相机数据,可用于分析野生动物活动节律,共存分析以及分布的限制因子等。
乔慧捷
为描述青藏高原及周边地区主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年5月子子课题3在甘肃省白银市靖远县开展家养动物遗传资源调查与采集工作。本次科考共采集当地滩羊耳组织156份、山羊耳组织44份、藏羊耳组织25份,共计225份。同时记录了个体的体长、体高、体重、出生日期、采集日期、年龄、性别等信息,拍摄了个体照片,并通过问卷调查的方式获得了饲养方式、饲养食物情况等信息。
田菲
西藏自治区生态资源消耗数据集包括省级-市级-县级三个尺度的2000-2019年生态资源消耗数据,根据西藏自治区实际情况,生态资源消耗主要指农牧业生产活动中消耗的生态资源量。生态资源消耗量计算是基于粮食产量数据、牲畜存栏量数据和畜产品产量数据,结合人类占用净初级生产力(HANPP)的评估方法,将生物量数据转换为碳含量数据,进而测算出生态资源消耗量。生态资源消耗量数据是生态压力与生态承载力研究的基础数据,可以直接揭示人类农牧业生产活动对生态系统带来的压力。
闫慧敏
为收集青藏高原特殊种质资源,并挖掘影响特殊种质资源的分子标记,依据遗传标记信息,选择具有优异位点的个体绵羊进行标记辅助选择、扩繁和世代选育,培育特殊种质资源的家系。2021年本子课题(2019QZKK05010704)在青海海北广泛收集青海藏羊和青海细毛羊样品,在乐都农业试验站及青海省三角城种羊场继续组建并扩充第一、二核心群。本数据集包含1050份组织样本基本信息,包括品种、采集地、采集时间、性别、组织类型、保存方法等。
赵凯
为解析大额牛基因组特征、驯化以及种群历史、种群遗传多样性特征、种群分化特征,以及大额牛优秀肉质经济性状的遗传基础,2021年本子课题(2019QZKK05010703)在云南省昆明市、文山苗族自治州调查独龙牛、高峰牛遗传资源,采集心肝脾肺肾各脏器组织样品。为大额牛种质资源的保护、开发和利用提供科学理论参考,促进我国高端肉牛产业的发展。 本数据集包含个体照片、组织样品信息表,信息表记录品种、采集地、采集时间、样品类型、取样部位等基本信息。
李艳
为掌握高原农牧象虫以及相关鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫物种组成、区系特点及寄主信息,建立高原农牧天敌昆虫的DNA条形码快速鉴定体系,评估天敌资源现状,提出天敌昆虫可持续利用建议。子课题2019QZKK05010606在青藏高原开展重点农牧区、大宗作物相关象虫以及鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫资源调查,天敌昆虫物种多样性数据库建设,天敌资源现状评估和可持续利用评估。2020年期间西藏自治区、云南省农牧交错区、农林交错区,农区与牧区腹地,开展农牧鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫关键类群调查,进行标本采集、样品采集,生物学信息与生态环境信息收集等,按照标准和规范系统整理天敌昆虫标本,并有效保藏,开展物种形态鉴定并获取DNA条形码信息,整合物种地理分布、寄主信息、生态图片等信息,构建天敌物种多样性信息库;对天敌资源现状进行评估并提出可持续利用的建议。
刘宁
为掌握高原农牧象虫以及相关鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫物种组成、区系特点及寄主信息,建立高原农牧天敌昆虫的DNA条形码快速鉴定体系,评估天敌资源现状,提出天敌昆虫可持续利用建议。子课题2019QZKK05010601在青藏高原开展重点农牧区、大宗作物相关象虫以及鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫资源调查,天敌昆虫物种多样性数据库建设,天敌资源现状评估和可持续利用评估。2020年期间西藏自治区、云南省农牧交错区、农林交错区,农区与牧区腹地,开展农牧鞘翅目、脉翅目、双翅目等天敌昆虫关键类群调查,进行标本采集、样品采集,生物学信息与生态环境信息收集等,按照标准和规范系统整理天敌昆虫标本,并有效保藏,开展物种形态鉴定并获取DNA条形码信息,整合物种地理分布、寄主信息、生态图片等信息,构建天敌物种多样性信息库;对天敌资源现状进行评估并提出可持续利用的建议。
乔格侠
子课题(2019QZKK05010411)以野牦牛、藏羚和棕熊种群调查监测为核心内容,开展系统而持续的野外考察工作,查清它们的地理分布、种群数量、种群结构等,开展适宜栖息地评估。分别选取其分布区和潜在分布区,划分为多个子区域,根据生境类型、气候、海拔等因素采用分层随机抽样,分别采用总体计数法、可变距离样线法或固定宽度样线法进行考察。同时针对棕熊的极低遇见率,结合访谈法进行。考察区域主要包括青海省玉树藏族自治州、海西蒙古族藏族自治州、海北藏族自治州和其他州县该三种动物的分布区和潜在分布区,以期掌握青海省境内的野牦牛、藏羚、棕熊分布和五年的种群动态情况。本数据集包含2021年在青海调查牦牛、藏羚和棕熊拍摄的照片和视频。
陈振宁
为描述青藏高原重要啮齿动物遗传多样性分布格局,厘清其相关遗传背景,分析其在全球气候变化的大背景下种群波动规律及其影响因素,分析高原鼠兔对鸟类的影响和在维持生态系统稳定性中的意义,为探讨高原物种的适应与进化机制、构建种群暴发预测预警体系,正确认识高原鼠兔在生态系统中的地位和作用,提出及时有效的种群管理对策具有重要的理论和实践意义。子课题(2019QZKK05010410)2021年集中在青海海西蒙古藏族自治州、果洛州、海南州调查高原鼠兔,共采集200份高原鼠兔脾、肺等组织样品。本数据集包含1个样品信息表,照片。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
曲家鹏
利用卫星追踪技术,子课题(2019QZKK05010409)对黑颈鹤中部越冬种群开展追踪工作。通过脚扣法捕捉黑颈鹤后,我们采取脚环式方法固定追踪器,大大提高了追踪的成果率以及获取的数据量。电量理想的情况下,采样频率可以加快到半个小时一个点。获取更精细的追踪数据。相关结果,显示黑颈鹤对越冬地的选择具有高度的稳定性,初步的分析发现黑颈鹤的越冬地和繁殖地之间,具有强连接线,但也存在着幼体在不同度夏地活动的特征。强的迁徙连接性,预示着黑颈鹤更容易受到环境改变的伤害。本数据集包含黑颈鹤生境照200张、黑颈鹤幼鸟活动数据1276条。黑颈鹤幼年个体卫星追踪数据信息表记录经纬度、日期、高度、速度、温度等信息。
伍和启
高原鼢鼠和高原鼠兔是广泛分布于青藏高原及周边平原地区的特有种和关键物种,不同的地理位置和生态环境造成了多样化的物种形成。这些物种的起源和演化的研究还有待完善。同时,它们的地理分布和形态特征是很好的研究高原适应和适应性进化的材料,比较高原与其他低海拔平原近缘种的基因组、转录组和表观遗传组学的分析,能够帮助解析高原适应的机制,初步探索表观修饰在高原适应中发挥作用的机制。2021年集中在青海省共采集16个动物的组织样本共计112份。本数据集包含一个样品信息表,样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。为探讨高原旗舰物种的高原适应性进化问题,对青海玛多县和拉脊山地区16个高原鼢鼠、鼠兔个体开展ChIP-seq测序转录组测序,每个个体产生15Gb数据,共600Gb。数据以fastq格式存储。
吕雪梅
为评估家栖鼠类对青藏高原生物多样性和人们生产生活的危害,评估后续潜在生态影响和风险,为制定更加科学有效的生物防控和生态保护措施提供全新的依据。子课题(2019QZKK05010303)2021年在西藏拉萨、青海海西州、四川成都调查高原境内家栖鼠类物种组成、种群特征、分布范围进行全面的实地调查,并采集家栖鼠类样品。共采集80份大家鼠、小家鼠组织样品。本数据集包含1个组织样品信息表,记录采集地、采集时间、物种、样品类型等信息。
靖美东
为描述青藏高原两栖爬行动物分布和外来动物造成的危害,厘清其相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年子课题(2019QZKK05010302)集中在西藏自治区昌都地区及周边共采集30份美洲牛蛙、泽陆蛙、多疣狭口蛙种质资源。本数据集包含1个标本信息表、1个组织样品信息表、生境照、标本照。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。
李义明
本子课题(2019QZKK05010217)拟选择对环境变化极为敏感的外温脊椎动物——青海沙蜥为代表,通过野外调查,比较青藏高原及邻近地区不同海拔青海沙蜥种群的形态、生理和生活史的差异,分析青海沙蜥对青藏高原环境变化的响应和适应特征,结合物种分布模型(SDM)和机制模型预测青海沙蜥未来的受胁程度,提出气候变暖背景下青藏高原青海沙蜥多样性的保护对策,为环境变化背景下的青藏高原爬行动物多样性保护提供理论依据。本数据包含青海省共和县、海晏县、玛多县青海沙蜥生态照、生境照等照片。
杜卫国
为分析西藏地区不同种群的沙蜥对环境变化的表型与遗传适应,本子课题(2019QZKK05010216)选择依据高原内海拔梯度垂直带为主线,在红尾沙蜥分布区全境采集标本,比较该种不同种群的形态、生理和生活史的差异,分析其对环境变化的表型与遗传适应,结合物种分布模型和机制模型预测红尾沙蜥未来的受胁程度,提出气候变暖背景下高原沙蜥的保护对策,为环境变化背景下的青藏高原爬行动物多样性保护提供理论依据。于2021年在甘肃省酒泉、青海省德令哈等地区采集沙蜥样品资源。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。照片,以jpg格式存储。
计翔
为了确定高原林蛙在青海沿纬度梯度的分布点以及生境类型,2021年集中在青海海东市民和县、海南藏族自治州共和县以及果洛州玛沁县等地区共采集高原林蛙分布点数据8个,海拔覆盖2000-3800m。本数据集包含1个坐标信息表和57张生境照片。坐标信息表包含编号、记录日期、时间、天气、坐标经纬度、海拔样、生境类型及代表生境照片编号等信息。为揭示气候变化对未来青藏高原高原林蛙多样性的影响,通过热生理学指标和环境有效温度等数据计算不同地理种群高原林蛙热安全阈度(thermal safety margin),评估不同地理种群高原林蛙受气候变暖受胁程度。本数据集包括高原林蛙四个海拔种群野外活动体温、静息代谢率、环境温度和形态数据,补充了2000m海拔种群的选择体温、耐受温度和温度校正数据。数据以excel格式存储。为研究不同海拔高原林蛙遗传多样性的差异,基于4个线粒体基因 (12S rRNA、16S rRNA、COI和Cytb) 序列,对采自青藏高原4个海拔梯度 (2000 m、2600 m、3200 m和3800 m)高原林蛙共计100个样本进行测序分析,以期为该物种的保护提供科学依据,本数据包括高原林蛙三个海拔种群12S rRNA、16S rRNA、COI和Cytb四个基因测序所得序列数据,补充了2000m海拔种群的四个基因序列数据。
张永普
为描述青藏高原小型哺乳动物环境变化和人为干扰对其时空分布影响,利用统计学模型,以及用分子技术手段明确不同海拔梯度小型哺乳动物种类。2021年在青海省的西海镇、刚察县、德令哈市等8个地区共采集105份高原鼠兔、子午沙鼠、三趾跳鼠、五趾跳鼠、青海松田鼠等小型哺乳动物资源,实体样品包括动物实体标本和肌肉、心、肝、脾、肺、肾、胰、膀胱、睾丸、卵巢。本数据集包含1个标本信息表、1个组织样品信息表和对应每个标本的1张照片。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。照片,以jpg格式存储。
侯祥
为了解青藏高原纳木错流域两栖类和鱼类的分布及其多样性,掌握区域两栖类和鱼类资源的基础数据。子课题(2019QZKK05010202)通过野外调查和对历史资料的分析,并结合卫片的解析探明近几十年来气候变化对纳木错流域脊椎动物多样性产生的影响。2021年集中在西藏自治区纳木错流域进行了全面调查。本数据集包含1个样品信息表和200张照片。样品信息表包含物种、品种、详细采样地、样品类型、采集时间、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。照片,以jpg格式存储。
赵天
为探讨青藏高原与横断山地区两栖爬行类物种多样性、遗传多样性与分布格局,厘清其分类与进化地位,以及相关遗传背景,并建立相应的遗传资源库。2021年整理出2020-2021年采集的两栖爬行动物标本50份、组织样本100份。本数据集包含1个样品信息表、1个标本信息表和300张照片。样品信息表包含物种、详细采样地、经纬度、海拔、采集时间、采集人、保存方式等基本样品信息,以excel表形式存储。照片,以jpg格式存储。
李家堂
子课题(2019QZKK05010121)通过对祁连山嘉峪关-酒泉-玉门-金塔地区进行系统性考察,查清4县(区)野生动物的种类、种群数量、地理分布、干扰状况及保护现状,建立该区域物种多样性数据库,撰写祁连山物种名录和野生动物考察报告。评估关键物种适宜栖息地,掌握不同区域、不同季节、不同生境物种多样性差异以及祁连山野生动物的动态变化规律,揭示物种多样性关键影响因素,为以后该地的生态及野生动物保护、管理决策提供科学依据。
陈家瑞
为全面掌握祁连山陆生野生动物资源现状,搜集保护区陆生野生动物种类分布、种群数量及栖息环境的相关数据,揭示物种多样性的关键影响因素和生态系统保持稳定的重要因素。子课题(2019QZKK05010120)对祁连山海晏-刚察-门源进行系统考察,详细调查这3个县(区)内野生动物的种类、种群数量、地理分布情况、生境信息、保护现状以及受威胁因素等进行,建立该区域物种多样性数据库,撰写该区域野生动物物种多样性调查与评估报告。并进一步评估该区域生物多样性、典型性、稀有性、脆弱性、自然性、科研价值等方面,揭示物种多样性的关键影响因素和生态系统保持稳定的重要因素,为生物多样性的保护与持续利用提出策略、建议和措施。
王喜凤
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