主要家养动物转录组测序数据(2021)

Transcriptome sequencing data of major domestic animals (2021)


为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景,我们对15个番鸭大脑、肺、肝等组织,10个珍珠鸡大脑、心、肾等组织,12个猪肝组织,8个猪肌肉组织,45个狗脑、肝、脾等组织提取总RNA,利用illumina 2000平台开展双端测序,获得转录组重测序数据。本数据集包含1个数据信息表(excel)和90个转录组原始数据(fastq)。数据信息表记录样本采集时间、采集地、测序时间等基本信息。为探索泛第三极地区主要家养动物驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,为进一步探讨驯化动物环境适应机理提供资料。


数据文件命名方式和使用方法

本数据集包含1个数据信息表(excel),可用excel软件打开。基因组原始数据(fastq)可用bwa软件比对。


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数据的引用

彭旻晟. (2021). 主要家养动物转录组测序数据(2021). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Others.tpdc.271959. CSTR: 18406.11.Others.tpdc.271959.
[Peng, M. (2021). Transcriptome sequencing data of major domestic animals (2021). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Others.tpdc.271959. CSTR: 18406.11.Others.tpdc.271959. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项(XDA20000000) (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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East: 104.22 West: 89.53
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数据细节
  • 时间分辨率: 年
  • 空间分辨率: --
  • 大小: 534,000 MB
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  • 下载量: 0 次
  • 共享方式: 保护期内
  • 数据时间范围: 2021-01-01 至 2021-12-31
  • 元数据更新时间: 2022-01-21

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联系信息
彭旻晟  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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