主要家养动物基因组重测序数据(2020)

Genome re sequencing data of major domestic animals (2020)


为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们对201个全球家鸡血液、组织等DNA组织样品提取总DNA后建库并做全基因组测序,同时下载已公布家鸡基因组数据一共863个家鸡基因组开展群体分析,为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集相关文章已发表,本数据集内所有数据提供fastq,bam,vcf,snp文件在线下载。


数据文件命名方式和使用方法

数据信息及下载表,excel格式,使用excel软件打开。


本数据要求的引用方式 查看数据引用帮助 数据引用必读
数据的引用

彭旻晟. (2020). 主要家养动物基因组重测序数据(2020). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.1038/s41422-020-0349-y.
[Peng, M. (2020). Genome re sequencing data of major domestic animals (2020). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.1038/s41422-020-0349-y. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

文章的引用

1. Wang, M.S., Thakur, M., Peng, M.S., Jiang, Y., Frantz, L.A.F., Li, M., Zhang, J.J., Wang, S., Peters, J., Otecko, N.O., Suwannapoom, C., Guo, X., Zheng, Z.Q., Esmailizadeh, A., Hirimuthugoda, N.Y., Ashari, H., Suladari, S., Zein, M.S.A., Kusza, S., Sohrabi, S., Kharrati-Koopaee, H., Shen, Q.K., Zeng, L., Yang, M.M., Wu, Y.J., Yang, X.Y., Lu, X.M., Jia, X.Z., Nie, Q.H., Lamont, S.J., Lasagna, E., Ceccobelli, S., Gunwardana, H., Senasige, T.M., Feng, S.H., Si, J.F., Zhang, H., Jin, J.Q., Li, M.L., Liu, Y.H., Chen, H.M., Ma, C., Dai, S.S., Bhuiyan, A., Khan, M.S., Silva, G., Le, T.T., Mwai, O.A., Ibrahim, M.N.M., Supple, M., Shapiro, B., Hanotte, O., Zhang, G., Larson, G., Han, J.L., Wu, D.D., Zhang, Y.P. (2020). 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Res. doi: 10.1038/s41422-020-0349-y.( 查看 | Bibtex格式)

使用本数据时必须引用“文章的引用”中列出的文献,并进行数据的引用


资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项(XDA20000000) (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

数据使用声明

为尊重知识产权、保障数据作者的权益、扩展数据中心的服务、评估数据的应用潜力,请数据使用者在使用数据所产生的研究成果中(包括公开发表的论文、论著、数据产品和未公开发表的研究报告、数据产品等成果),明确注明数据来源和数据作者。对于转载(二次或多次发布)的数据,作者还须注明原始数据来源。


License: This work is licensed under an Attribution 4.0 International (CC BY 4.0)


相关资源

1. 2024-06-27 10*   用途:免登录下载 ……

2. 2024-06-24 10*   用途:免登录下载 ……

3. 2024-06-22 10*   用途:免登录下载 ……

4. 2024-06-18 10*   用途:免登录下载 ……

5. 2024-06-16 10*   用途:免登录下载 ……

6. 2024-06-13 10*   用途:免登录下载 ……

7. 2024-06-10 10*   用途:免登录下载 ……

8. 2024-06-06 10*   用途:免登录下载 ……

9. 2024-06-04 10*   用途:免登录下载 ……

10. 2024-05-28 10*   用途:免登录下载 ……

11. 2024-05-16 10*   用途:免登录下载 ……

12. 2024-05-11 10*   用途:免登录下载 ……

13. 2024-05-10 10*   用途:免登录下载 ……

14. 2024-05-04 10*   用途:免登录下载 ……

15. 2024-04-21 10*   用途:免登录下载 ……

16. 2024-04-15 10*   用途:免登录下载 ……

17. 2024-04-10 10*   用途:免登录下载 ……

18. 2024-04-03 10*   用途:免登录下载 ……

19. 2024-03-28 10*   用途:免登录下载 ……

20. 2024-03-26 10*   用途:免登录下载 ……

暂无数据

数据评论

当前页面默认显示 中文 评论 显示所有语种的评论

申请下载 关注
关键词
空间位置
East: 104.22 West: 89.53
South: 31.34 North: 43.30
数据细节
  • 时间分辨率: 年
  • 空间分辨率: 1km - 10km
  • 大小: 1 MB
  • 浏览: 560 次
  • 下载量: 214 次
  • 共享方式: 申请获取
  • 数据时间范围: 2020-01-01 至 2020-12-31
  • 元数据更新时间: 2022-12-09
联系信息
彭旻晟  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

导出元数据