青藏高原阿木错、班戈错、帕隆4号冰川、玉珠峰冰芯可培养细菌菌落照片(2019)

Photos of culturable bacterial colonies in the Amuco, Bangkog Co, Palung 4 glacier and Yuzhufeng ice core on the Tibetan Plateau (2019)


该数据集包括青藏高原阿木错(AMC)、班戈错(BGC)、帕隆4号冰川(PL4)、玉珠峰冰芯(YZF)的可培养细菌菌落图片,可以体现菌落的颜色、透明度等基本信息。附有一个表格信息,包括菌落来源地的经纬度,水深及颜色等。

这些细菌从青藏高原冰雪、湖水等生境中分离得到,菌落表现出不同的颜色,这可能与细菌适应青藏高原强辐射、低温、寡营养的环境有关,通过不同的色素产能等来适应恶劣环境。菌落是通过湖水平板涂布,在低温(4℃)培养(培养基为R2A等)分离,确定无污染、为单菌落之后获得。得到的单菌落后续会进行16S rRNA全长测序,通过97%的相似度确定其是否为新的种;如果该序列与最相似菌株的序列相似度低于97%,会进行全基因组测区,确定该菌株在相应的属、科甚至门类中的系统发育关系,确定该菌株是否具有新的发育地位,补充青藏高原湖泊微生物多样性。


数据文件命名方式和使用方法

文件命名:图片命名方式为:Sites-type-Number.jpg,“Sites” 为样品采集地冰川、湖泊的缩写,如AMC即为湖泊Amuco的缩写,“-"代表分割线;”type“表示样品类型(L为湖水lake;SC为表面冰尘surface cryoconite;I为冰芯ice core);“Number”代表湖泊深度及原始序号。
数据读取方式:该数据集中照片可以直接使用图片软件(如windows照片查看器)打开。附件表格可使用Excel等软件打开查看。


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数据的引用

刘勇勤. (2021). 青藏高原阿木错、班戈错、帕隆4号冰川、玉珠峰冰芯可培养细菌菌落照片(2019). 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Ecolo.tpdc.271714. CSTR: 18406.11.Ecolo.tpdc.271714.
[Liu, Y. (2021). Photos of culturable bacterial colonies in the Amuco, Bangkog Co, Palung 4 glacier and Yuzhufeng ice core on the Tibetan Plateau (2019). A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Ecolo.tpdc.271714. CSTR: 18406.11.Ecolo.tpdc.271714. ] (下载引用: RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

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资助项目

第二次青藏高原综合科学考察研究 Second Tibetan Plateau Scientific Expedition Program

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East: 96.98 West: 88.72
South: 29.39 North: 35.66
数据细节
  • 时间分辨率: 月
  • 空间分辨率: 10km - 100km
  • 大小: 2 MB
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  • 下载量: 0 次
  • 共享方式: 申请获取
  • 数据时间范围: 2019-07-27 至 2019-08-16
  • 元数据更新时间: 2022-05-11
联系信息
刘勇勤  

分发方: 时空三极环境大数据平台

Email: poles@itpcas.ac.cn

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