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为了解析蔓菁如何、何时进入青藏高原，探讨蔓菁在青藏高原传播与驯化与早期人类活动的高原定居和古丝绸交流之间的关系，2018年6月，课题组利用三代基因组测序技术，对青海省囊谦县的蔓菁自交F1代品种进行全基因组测序和De Novo组装，得到组装基因组大小为409.69 Mb，Contig N50为1.21 Mb。这一结果可为研究植物扩散与人类活动之间的关系提供遗传基础。同时，这项研究有助于揭示人工驯化和人类选择对蔓菁的遗传分化的影响，以及蔓菁适应高原生态环境的适应性机制。

数据文件命名方式和使用方法

文件命名：基因组数据以文本格式存储，文件的名称为“20181106final.genome.fasta”，其中2018代表年，1106代表日期。数据读取方式：该数据可以直接用文本程序打开。（如：EditPlus）

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段元文. (2020). 蔓菁de novo基因组测序数据. 时空三极环境大数据平台, DOI: 10.11888/Geogra.tpdc.271070. CSTR: 18406.11.Geogra.tpdc.271070.
[Duan, Y. (2020). Genome sequencing data of cyanine de novo. A Big Earth Data Platform for Three Poles, DOI: 10.11888/Geogra.tpdc.271070. CSTR: 18406.11.Geogra.tpdc.271070. ] (下载引用： RIS格式 | RIS英文格式 | Bibtex格式 | Bibtex英文格式 )

1. 段元文，杨云强.蔓菁de novo基因组测序数据( 查看 | Bibtex格式)

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资助项目

泛第三极环境变化与绿色丝绸之路建设专项 (项目编号:XDA20000000) Pan-Third Pole Environment Study for a Green Silk Road-A CAS Strategic Priority A Program

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