Post-processing products for typical year soil bacteria distribution in the Tripolar regions (2005, 2006, 2015)
典型年三极土壤微生物后处理产品收集了2005-2006年期间南北极地区土壤采样细菌分布分析结果和2015年期间青藏高原地区土壤采样细菌分布分析结果。通过整理归纳汇总得到三极区域土壤微生物后处理数据产品，数据格式为excel，方便用户查看。其中南北极地区样品采集时间为2005年12月13日至2006年12月8日，包含北极3个地区52个样品（Spitsbergen Slijeringa，Spitsbergen Vestpynten，及Alexandra Fjord Highlands），南极5个地区171个样品（Mitchell Peninsula,Casey station main power house, Robinsons Ridge，Herring Island，Browning Peninsula）；青藏高原采集时间为2015年7月1日至7月15日，包含草甸，草原，荒漠3种生态系统，共计18个采样点位，每个采样点位样品个数为3-5个。采样点降水、气温和干旱度由气象信息估算得到，供读者参考。土壤表层样品采集后用液氮保存，运回悉尼实验室，通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用27F（5'-GAGTTTGATCNTGGCTCA-3'）和 519R (5'-GTNTTACNGCGGCKGCTG-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过454方式测序，原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列，之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度，相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU，并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对，在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。
1. 投影：WGS84
2. 数据大小：2,504 KB
3. 数据格式：Excel数据库
叶爱中. (2022). 典型年三极土壤微生物后处理产品（2005，2006，2015）. 时空三极环境大数据平台,
DOI:
10.11888/Terre.tpdc.272726.
CSTR:
18406.11.Terre.tpdc.272726.
[Ye, A. (2022). Post-processing products for typical year soil bacteria distribution in the Tripolar regions (2005, 2006, 2015). A Big Earth Data Platform for Three Poles,
DOI:
10.11888/Terre.tpdc.272726.
CSTR:
18406.11.Terre.tpdc.272726.
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1.Ray, A. E., Zhang, E., Terauds, A., Ji, M., Kong, W., & Ferrari, B. C. (2020). Soil microbiomes with the genetic capacity for atmospheric chemosynthesis are widespread across the Poles and are associated with moisture, carbon, and nitrogen limitation. Frontiers in microbiology, 1936. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.01936 (查看 )
地球大数据科学工程专项时空三极环境项目(XDA19000000) (项目编号:XDA19000000) CASEarth:Big Earth Data for Three Poles（grant No. XDA19070000）
三极环境大数据分析方法库及其科学应用示范(XDA19070104) (项目编号:XDA19070104) [XDA19070104] the Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences
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